Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARHGEF3Q9NR81 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARHGEF3Q9NR81 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ARHGEF3Q9NR81 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARHGEF3Q9NR81 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARHGEF3Q9NR81 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARHGEF3Q9NR81 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARHGEF3Q9NR81 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARHGEF3Q9NR81 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARHGEF3Q9NR81 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARHGEF3Q9NR81 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARHGEF3Q9NR81 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARHGEF3Q9NR81 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ARHGEF3Q9NR81 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARHGEF3Q9NR81 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARHGEF3Q9NR81 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARHGEF3Q9NR81 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARHGEF3Q9NR81 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARHGEF3Q9NR81 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARHGEF3Q9NR81 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ARHGEF3Q9NR81 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ARHGEF3Q9NR81 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARHGEF3Q9NR81 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARHGEF3Q9NR81 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARHGEF3Q9NR81 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARHGEF3Q9NR81 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARHGEF3Q9NR81 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARHGEF3Q9NR81 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGEF3Q9NR81 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGEF3Q9NR81 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGEF3Q9NR81 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGEF3Q9NR81 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARHGEF3Q9NR81 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARHGEF3Q9NR81 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ARHGEF3Q9NR81 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ARHGEF3Q9NR81 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF3Q9NR81 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF3Q9NR81 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF3Q9NR81 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF3Q9NR81 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF3Q9NR81 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF3Q9NR81 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF3Q9NR81 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF3Q9NR81 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF3Q9NR81 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF3Q9NR81 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGEF3Q9NR81 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGEF3Q9NR81 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGEF3Q9NR81 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGEF3Q9NR81 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF3Q9NR81 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF3Q9NR81 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF3Q9NR81 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF3Q9NR81 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF3Q9NR81 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF3Q9NR81 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARHGEF3Q9NR81 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARHGEF3Q9NR81 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ARHGEF3Q9NR81 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ARHGEF3Q9NR81 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF3Q9NR81 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF3Q9NR81 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF3Q9NR81 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF3Q9NR81 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF3Q9NR81 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF3Q9NR81 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF3Q9NR81 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF3Q9NR81 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF3Q9NR81 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF3Q9NR81 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF3Q9NR81 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF3Q9NR81 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGEF3Q9NR81 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGEF3Q9NR81 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGEF3Q9NR81 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARHGEF3Q9NR81 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARHGEF3Q9NR81 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARHGEF3Q9NR81 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms