Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR19

ACSS2, Acetyl-coenzyme A synthetase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS2Q9NR19 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACSS2Q9NR19 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACSS2Q9NR19 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACSS2Q9NR19 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACSS2Q9NR19 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACSS2Q9NR19 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACSS2Q9NR19 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACSS2Q9NR19 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACSS2Q9NR19 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACSS2Q9NR19 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACSS2Q9NR19 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACSS2Q9NR19 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACSS2Q9NR19 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACSS2Q9NR19 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACSS2Q9NR19 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACSS2Q9NR19 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACSS2Q9NR19 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSS2Q9NR19 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSS2Q9NR19 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSS2Q9NR19 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSS2Q9NR19 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSS2Q9NR19 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSS2Q9NR19 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSS2Q9NR19 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSS2Q9NR19 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSS2Q9NR19 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSS2Q9NR19 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSS2Q9NR19 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSS2Q9NR19 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSS2Q9NR19 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSS2Q9NR19 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSS2Q9NR19 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSS2Q9NR19 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACSS2Q9NR19 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACSS2Q9NR19 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACSS2Q9NR19 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACSS2Q9NR19 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ACSS2Q9NR19 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ACSS2Q9NR19 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ACSS2Q9NR19 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACSS2Q9NR19 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACSS2Q9NR19 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACSS2Q9NR19 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACSS2Q9NR19 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACSS2Q9NR19 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACSS2Q9NR19 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACSS2Q9NR19 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACSS2Q9NR19 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACSS2Q9NR19 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ACSS2Q9NR19 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACSS2Q9NR19 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACSS2Q9NR19 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACSS2Q9NR19 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACSS2Q9NR19 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACSS2Q9NR19 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACSS2Q9NR19 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACSS2Q9NR19 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACSS2Q9NR19 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACSS2Q9NR19 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACSS2Q9NR19 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACSS2Q9NR19 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACSS2Q9NR19 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACSS2Q9NR19 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ACSS2Q9NR19 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACSS2Q9NR19 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACSS2Q9NR19 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACSS2Q9NR19 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACSS2Q9NR19 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSS2Q9NR19 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSS2Q9NR19 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSS2Q9NR19 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSS2Q9NR19 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSS2Q9NR19 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSS2Q9NR19 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSS2Q9NR19 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSS2Q9NR19 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACSS2Q9NR19 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACSS2Q9NR19 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACSS2Q9NR19 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACSS2Q9NR19 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACSS2Q9NR19 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACSS2Q9NR19 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACSS2Q9NR19 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACSS2Q9NR19 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSS2Q9NR19 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSS2Q9NR19 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSS2Q9NR19 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSS2Q9NR19 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSS2Q9NR19 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACSS2Q9NR19 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACSS2Q9NR19 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACSS2Q9NR19 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSS2Q9NR19 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSS2Q9NR19 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSS2Q9NR19 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSS2Q9NR19 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSS2Q9NR19 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSS2Q9NR19 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSS2Q9NR19 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSS2Q9NR19 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms