Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW5

PRDM7, Probable histone-lysine N-methyltransferase PRDM7, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM7Q9NQW5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM7Q9NQW5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM7Q9NQW5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM7Q9NQW5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM7Q9NQW5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM7Q9NQW5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM7Q9NQW5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM7Q9NQW5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM7Q9NQW5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM7Q9NQW5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM7Q9NQW5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM7Q9NQW5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM7Q9NQW5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM7Q9NQW5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM7Q9NQW5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM7Q9NQW5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM7Q9NQW5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM7Q9NQW5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM7Q9NQW5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM7Q9NQW5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM7Q9NQW5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM7Q9NQW5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM7Q9NQW5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM7Q9NQW5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM7Q9NQW5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM7Q9NQW5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM7Q9NQW5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM7Q9NQW5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM7Q9NQW5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM7Q9NQW5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM7Q9NQW5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM7Q9NQW5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM7Q9NQW5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM7Q9NQW5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM7Q9NQW5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM7Q9NQW5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM7Q9NQW5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM7Q9NQW5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM7Q9NQW5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM7Q9NQW5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM7Q9NQW5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM7Q9NQW5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM7Q9NQW5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM7Q9NQW5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM7Q9NQW5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM7Q9NQW5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM7Q9NQW5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM7Q9NQW5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM7Q9NQW5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM7Q9NQW5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM7Q9NQW5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM7Q9NQW5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM7Q9NQW5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM7Q9NQW5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM7Q9NQW5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM7Q9NQW5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM7Q9NQW5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM7Q9NQW5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM7Q9NQW5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM7Q9NQW5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM7Q9NQW5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM7Q9NQW5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM7Q9NQW5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM7Q9NQW5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM7Q9NQW5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM7Q9NQW5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM7Q9NQW5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM7Q9NQW5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM7Q9NQW5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM7Q9NQW5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM7Q9NQW5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM7Q9NQW5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM7Q9NQW5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM7Q9NQW5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM7Q9NQW5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM7Q9NQW5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM7Q9NQW5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM7Q9NQW5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM7Q9NQW5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM7Q9NQW5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM7Q9NQW5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM7Q9NQW5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM7Q9NQW5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRDM7Q9NQW5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRDM7Q9NQW5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRDM7Q9NQW5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM7Q9NQW5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM7Q9NQW5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM7Q9NQW5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM7Q9NQW5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM7Q9NQW5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM7Q9NQW5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM7Q9NQW5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM7Q9NQW5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM7Q9NQW5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM7Q9NQW5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM7Q9NQW5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM7Q9NQW5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM7Q9NQW5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDM7Q9NQW5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms