Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ34

TMEM9B, Transmembrane protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM9BQ9NQ34 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM9BQ9NQ34 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM9BQ9NQ34 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM9BQ9NQ34 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM9BQ9NQ34 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM9BQ9NQ34 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM9BQ9NQ34 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM9BQ9NQ34 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM9BQ9NQ34 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM9BQ9NQ34 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM9BQ9NQ34 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM9BQ9NQ34 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM9BQ9NQ34 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM9BQ9NQ34 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM9BQ9NQ34 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM9BQ9NQ34 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM9BQ9NQ34 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM9BQ9NQ34 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM9BQ9NQ34 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM9BQ9NQ34 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM9BQ9NQ34 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM9BQ9NQ34 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM9BQ9NQ34 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM9BQ9NQ34 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM9BQ9NQ34 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM9BQ9NQ34 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM9BQ9NQ34 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM9BQ9NQ34 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM9BQ9NQ34 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM9BQ9NQ34 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM9BQ9NQ34 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM9BQ9NQ34 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM9BQ9NQ34 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM9BQ9NQ34 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM9BQ9NQ34 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM9BQ9NQ34 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM9BQ9NQ34 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM9BQ9NQ34 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM9BQ9NQ34 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM9BQ9NQ34 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM9BQ9NQ34 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM9BQ9NQ34 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM9BQ9NQ34 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM9BQ9NQ34 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM9BQ9NQ34 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM9BQ9NQ34 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM9BQ9NQ34 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM9BQ9NQ34 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM9BQ9NQ34 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM9BQ9NQ34 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM9BQ9NQ34 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM9BQ9NQ34 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM9BQ9NQ34 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM9BQ9NQ34 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM9BQ9NQ34 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM9BQ9NQ34 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM9BQ9NQ34 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM9BQ9NQ34 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM9BQ9NQ34 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM9BQ9NQ34 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM9BQ9NQ34 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM9BQ9NQ34 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM9BQ9NQ34 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM9BQ9NQ34 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM9BQ9NQ34 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM9BQ9NQ34 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM9BQ9NQ34 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM9BQ9NQ34 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM9BQ9NQ34 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM9BQ9NQ34 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM9BQ9NQ34 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM9BQ9NQ34 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM9BQ9NQ34 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM9BQ9NQ34 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM9BQ9NQ34 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM9BQ9NQ34 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM9BQ9NQ34 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM9BQ9NQ34 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM9BQ9NQ34 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM9BQ9NQ34 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM9BQ9NQ34 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM9BQ9NQ34 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM9BQ9NQ34 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM9BQ9NQ34 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM9BQ9NQ34 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM9BQ9NQ34 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM9BQ9NQ34 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM9BQ9NQ34 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM9BQ9NQ34 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM9BQ9NQ34 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM9BQ9NQ34 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM9BQ9NQ34 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM9BQ9NQ34 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM9BQ9NQ34 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM9BQ9NQ34 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM9BQ9NQ34 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM9BQ9NQ34 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM9BQ9NQ34 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM9BQ9NQ34 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM9BQ9NQ34 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms