Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA4BQ9NPR2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SEMA4BQ9NPR2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA4BQ9NPR2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA4BQ9NPR2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA4BQ9NPR2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA4BQ9NPR2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA4BQ9NPR2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA4BQ9NPR2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA4BQ9NPR2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA4BQ9NPR2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA4BQ9NPR2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA4BQ9NPR2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA4BQ9NPR2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA4BQ9NPR2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA4BQ9NPR2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA4BQ9NPR2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA4BQ9NPR2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA4BQ9NPR2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA4BQ9NPR2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA4BQ9NPR2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA4BQ9NPR2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA4BQ9NPR2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA4BQ9NPR2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA4BQ9NPR2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA4BQ9NPR2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA4BQ9NPR2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA4BQ9NPR2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA4BQ9NPR2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA4BQ9NPR2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA4BQ9NPR2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA4BQ9NPR2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA4BQ9NPR2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA4BQ9NPR2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms