Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRC4Q9NPP4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRC4Q9NPP4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRC4Q9NPP4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRC4Q9NPP4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRC4Q9NPP4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRC4Q9NPP4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRC4Q9NPP4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
NLRC4Q9NPP4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NLRC4Q9NPP4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NLRC4Q9NPP4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NLRC4Q9NPP4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRC4Q9NPP4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRC4Q9NPP4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRC4Q9NPP4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRC4Q9NPP4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRC4Q9NPP4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRC4Q9NPP4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRC4Q9NPP4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRC4Q9NPP4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRC4Q9NPP4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRC4Q9NPP4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRC4Q9NPP4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRC4Q9NPP4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRC4Q9NPP4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRC4Q9NPP4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRC4Q9NPP4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRC4Q9NPP4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRC4Q9NPP4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRC4Q9NPP4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRC4Q9NPP4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRC4Q9NPP4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRC4Q9NPP4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRC4Q9NPP4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRC4Q9NPP4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRC4Q9NPP4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRC4Q9NPP4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRC4Q9NPP4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRC4Q9NPP4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRC4Q9NPP4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRC4Q9NPP4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRC4Q9NPP4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRC4Q9NPP4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRC4Q9NPP4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRC4Q9NPP4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NLRC4Q9NPP4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NLRC4Q9NPP4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NLRC4Q9NPP4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NLRC4Q9NPP4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRC4Q9NPP4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRC4Q9NPP4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRC4Q9NPP4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRC4Q9NPP4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRC4Q9NPP4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRC4Q9NPP4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRC4Q9NPP4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRC4Q9NPP4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRC4Q9NPP4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRC4Q9NPP4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRC4Q9NPP4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRC4Q9NPP4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRC4Q9NPP4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRC4Q9NPP4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRC4Q9NPP4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NLRC4Q9NPP4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NLRC4Q9NPP4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NLRC4Q9NPP4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NLRC4Q9NPP4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NLRC4Q9NPP4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NLRC4Q9NPP4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NLRC4Q9NPP4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRC4Q9NPP4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRC4Q9NPP4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRC4Q9NPP4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRC4Q9NPP4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRC4Q9NPP4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NLRC4Q9NPP4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NLRC4Q9NPP4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NLRC4Q9NPP4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms