Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARFGAP3Q9NP61 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARFGAP3Q9NP61 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARFGAP3Q9NP61 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARFGAP3Q9NP61 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARFGAP3Q9NP61 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ARFGAP3Q9NP61 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ARFGAP3Q9NP61 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARFGAP3Q9NP61 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARFGAP3Q9NP61 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARFGAP3Q9NP61 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARFGAP3Q9NP61 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARFGAP3Q9NP61 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARFGAP3Q9NP61 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARFGAP3Q9NP61 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARFGAP3Q9NP61 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARFGAP3Q9NP61 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARFGAP3Q9NP61 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARFGAP3Q9NP61 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARFGAP3Q9NP61 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARFGAP3Q9NP61 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARFGAP3Q9NP61 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARFGAP3Q9NP61 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARFGAP3Q9NP61 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARFGAP3Q9NP61 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARFGAP3Q9NP61 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARFGAP3Q9NP61 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ARFGAP3Q9NP61 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ARFGAP3Q9NP61 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARFGAP3Q9NP61 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARFGAP3Q9NP61 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ARFGAP3Q9NP61 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARFGAP3Q9NP61 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ARFGAP3Q9NP61 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARFGAP3Q9NP61 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARFGAP3Q9NP61 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARFGAP3Q9NP61 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARFGAP3Q9NP61 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARFGAP3Q9NP61 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARFGAP3Q9NP61 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARFGAP3Q9NP61 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARFGAP3Q9NP61 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARFGAP3Q9NP61 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARFGAP3Q9NP61 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARFGAP3Q9NP61 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARFGAP3Q9NP61 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARFGAP3Q9NP61 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARFGAP3Q9NP61 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARFGAP3Q9NP61 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARFGAP3Q9NP61 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARFGAP3Q9NP61 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARFGAP3Q9NP61 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARFGAP3Q9NP61 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARFGAP3Q9NP61 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARFGAP3Q9NP61 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARFGAP3Q9NP61 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARFGAP3Q9NP61 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARFGAP3Q9NP61 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARFGAP3Q9NP61 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ARFGAP3Q9NP61 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARFGAP3Q9NP61 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARFGAP3Q9NP61 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARFGAP3Q9NP61 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARFGAP3Q9NP61 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARFGAP3Q9NP61 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARFGAP3Q9NP61 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARFGAP3Q9NP61 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARFGAP3Q9NP61 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ARFGAP3Q9NP61 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARFGAP3Q9NP61 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARFGAP3Q9NP61 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARFGAP3Q9NP61 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ARFGAP3Q9NP61 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARFGAP3Q9NP61 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARFGAP3Q9NP61 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARFGAP3Q9NP61 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARFGAP3Q9NP61 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARFGAP3Q9NP61 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARFGAP3Q9NP61 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARFGAP3Q9NP61 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARFGAP3Q9NP61 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARFGAP3Q9NP61 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARFGAP3Q9NP61 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARFGAP3Q9NP61 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARFGAP3Q9NP61 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARFGAP3Q9NP61 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARFGAP3Q9NP61 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ARFGAP3Q9NP61 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARFGAP3Q9NP61 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARFGAP3Q9NP61 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARFGAP3Q9NP61 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARFGAP3Q9NP61 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ARFGAP3Q9NP61 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARFGAP3Q9NP61 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ARFGAP3Q9NP61 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARFGAP3Q9NP61 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARFGAP3Q9NP61 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARFGAP3Q9NP61 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.8 ms