Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVK-5Q9HDB9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVK-5Q9HDB9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVK-5Q9HDB9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVK-5Q9HDB9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVK-5Q9HDB9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVK-5Q9HDB9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERVK-5Q9HDB9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERVK-5Q9HDB9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ERVK-5Q9HDB9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERVK-5Q9HDB9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERVK-5Q9HDB9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERVK-5Q9HDB9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERVK-5Q9HDB9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ERVK-5Q9HDB9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVK-5Q9HDB9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVK-5Q9HDB9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVK-5Q9HDB9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVK-5Q9HDB9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVK-5Q9HDB9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVK-5Q9HDB9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVK-5Q9HDB9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERVK-5Q9HDB9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERVK-5Q9HDB9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERVK-5Q9HDB9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERVK-5Q9HDB9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERVK-5Q9HDB9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERVK-5Q9HDB9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERVK-5Q9HDB9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERVK-5Q9HDB9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERVK-5Q9HDB9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERVK-5Q9HDB9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ERVK-5Q9HDB9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERVK-5Q9HDB9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERVK-5Q9HDB9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ERVK-5Q9HDB9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERVK-5Q9HDB9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERVK-5Q9HDB9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVK-5Q9HDB9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVK-5Q9HDB9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVK-5Q9HDB9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVK-5Q9HDB9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVK-5Q9HDB9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVK-5Q9HDB9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVK-5Q9HDB9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVK-5Q9HDB9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVK-5Q9HDB9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVK-5Q9HDB9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ERVK-5Q9HDB9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERVK-5Q9HDB9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERVK-5Q9HDB9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERVK-5Q9HDB9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ERVK-5Q9HDB9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERVK-5Q9HDB9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERVK-5Q9HDB9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERVK-5Q9HDB9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERVK-5Q9HDB9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVK-5Q9HDB9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVK-5Q9HDB9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVK-5Q9HDB9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVK-5Q9HDB9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVK-5Q9HDB9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVK-5Q9HDB9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVK-5Q9HDB9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVK-5Q9HDB9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERVK-5Q9HDB9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERVK-5Q9HDB9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ERVK-5Q9HDB9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERVK-5Q9HDB9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERVK-5Q9HDB9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERVK-5Q9HDB9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERVK-5Q9HDB9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERVK-5Q9HDB9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERVK-5Q9HDB9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERVK-5Q9HDB9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERVK-5Q9HDB9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERVK-5Q9HDB9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERVK-5Q9HDB9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERVK-5Q9HDB9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERVK-5Q9HDB9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERVK-5Q9HDB9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERVK-5Q9HDB9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERVK-5Q9HDB9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERVK-5Q9HDB9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERVK-5Q9HDB9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERVK-5Q9HDB9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ERVK-5Q9HDB9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERVK-5Q9HDB9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERVK-5Q9HDB9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERVK-5Q9HDB9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERVK-5Q9HDB9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERVK-5Q9HDB9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERVK-5Q9HDB9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERVK-5Q9HDB9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERVK-5Q9HDB9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERVK-5Q9HDB9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERVK-5Q9HDB9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ERVK-5Q9HDB9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERVK-5Q9HDB9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERVK-5Q9HDB9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms