Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCX3

ZNF304, Zinc finger protein 304, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF304Q9HCX3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF304Q9HCX3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF304Q9HCX3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF304Q9HCX3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF304Q9HCX3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF304Q9HCX3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF304Q9HCX3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF304Q9HCX3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF304Q9HCX3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF304Q9HCX3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF304Q9HCX3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF304Q9HCX3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF304Q9HCX3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF304Q9HCX3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF304Q9HCX3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF304Q9HCX3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF304Q9HCX3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF304Q9HCX3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF304Q9HCX3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF304Q9HCX3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF304Q9HCX3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF304Q9HCX3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF304Q9HCX3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF304Q9HCX3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF304Q9HCX3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF304Q9HCX3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF304Q9HCX3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF304Q9HCX3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF304Q9HCX3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF304Q9HCX3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF304Q9HCX3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF304Q9HCX3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF304Q9HCX3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF304Q9HCX3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF304Q9HCX3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF304Q9HCX3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF304Q9HCX3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF304Q9HCX3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF304Q9HCX3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF304Q9HCX3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF304Q9HCX3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF304Q9HCX3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF304Q9HCX3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF304Q9HCX3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF304Q9HCX3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF304Q9HCX3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF304Q9HCX3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF304Q9HCX3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF304Q9HCX3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF304Q9HCX3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF304Q9HCX3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF304Q9HCX3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF304Q9HCX3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF304Q9HCX3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF304Q9HCX3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF304Q9HCX3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF304Q9HCX3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF304Q9HCX3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF304Q9HCX3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF304Q9HCX3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF304Q9HCX3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF304Q9HCX3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF304Q9HCX3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF304Q9HCX3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF304Q9HCX3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF304Q9HCX3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF304Q9HCX3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF304Q9HCX3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF304Q9HCX3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF304Q9HCX3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF304Q9HCX3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF304Q9HCX3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF304Q9HCX3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF304Q9HCX3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF304Q9HCX3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF304Q9HCX3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF304Q9HCX3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF304Q9HCX3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF304Q9HCX3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF304Q9HCX3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF304Q9HCX3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF304Q9HCX3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF304Q9HCX3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF304Q9HCX3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF304Q9HCX3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF304Q9HCX3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF304Q9HCX3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF304Q9HCX3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF304Q9HCX3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF304Q9HCX3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF304Q9HCX3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF304Q9HCX3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF304Q9HCX3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF304Q9HCX3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF304Q9HCX3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF304Q9HCX3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF304Q9HCX3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF304Q9HCX3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF304Q9HCX3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF304Q9HCX3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms