Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ELL3Q9HB65 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ELL3Q9HB65 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ELL3Q9HB65 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ELL3Q9HB65 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ELL3Q9HB65 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ELL3Q9HB65 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ELL3Q9HB65 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ELL3Q9HB65 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ELL3Q9HB65 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ELL3Q9HB65 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ELL3Q9HB65 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ELL3Q9HB65 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ELL3Q9HB65 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ELL3Q9HB65 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ELL3Q9HB65 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ELL3Q9HB65 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ELL3Q9HB65 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ELL3Q9HB65 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ELL3Q9HB65 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ELL3Q9HB65 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ELL3Q9HB65 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ELL3Q9HB65 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ELL3Q9HB65 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ELL3Q9HB65 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ELL3Q9HB65 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ELL3Q9HB65 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ELL3Q9HB65 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ELL3Q9HB65 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ELL3Q9HB65 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ELL3Q9HB65 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ELL3Q9HB65 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ELL3Q9HB65 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ELL3Q9HB65 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ELL3Q9HB65 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ELL3Q9HB65 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELL3Q9HB65 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELL3Q9HB65 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELL3Q9HB65 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELL3Q9HB65 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELL3Q9HB65 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELL3Q9HB65 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELL3Q9HB65 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELL3Q9HB65 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELL3Q9HB65 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELL3Q9HB65 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ELL3Q9HB65 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELL3Q9HB65 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELL3Q9HB65 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELL3Q9HB65 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELL3Q9HB65 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELL3Q9HB65 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELL3Q9HB65 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELL3Q9HB65 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELL3Q9HB65 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELL3Q9HB65 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ELL3Q9HB65 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ELL3Q9HB65 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELL3Q9HB65 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELL3Q9HB65 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELL3Q9HB65 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELL3Q9HB65 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELL3Q9HB65 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELL3Q9HB65 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELL3Q9HB65 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELL3Q9HB65 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELL3Q9HB65 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELL3Q9HB65 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELL3Q9HB65 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELL3Q9HB65 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELL3Q9HB65 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELL3Q9HB65 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ELL3Q9HB65 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELL3Q9HB65 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELL3Q9HB65 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELL3Q9HB65 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ELL3Q9HB65 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ELL3Q9HB65 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ELL3Q9HB65 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ELL3Q9HB65 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ELL3Q9HB65 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ELL3Q9HB65 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ELL3Q9HB65 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ELL3Q9HB65 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ELL3Q9HB65 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ELL3Q9HB65 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ELL3Q9HB65 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ELL3Q9HB65 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ELL3Q9HB65 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ELL3Q9HB65 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ELL3Q9HB65 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ELL3Q9HB65 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ELL3Q9HB65 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ELL3Q9HB65 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ELL3Q9HB65 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ELL3Q9HB65 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ELL3Q9HB65 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ELL3Q9HB65 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ELL3Q9HB65 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ELL3Q9HB65 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms