Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB55

CYP3A43, Cytochrome P450 3A43, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP3A43Q9HB55 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYP3A43Q9HB55 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYP3A43Q9HB55 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYP3A43Q9HB55 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP3A43Q9HB55 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP3A43Q9HB55 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP3A43Q9HB55 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP3A43Q9HB55 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP3A43Q9HB55 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP3A43Q9HB55 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP3A43Q9HB55 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP3A43Q9HB55 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP3A43Q9HB55 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP3A43Q9HB55 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP3A43Q9HB55 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP3A43Q9HB55 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP3A43Q9HB55 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CYP3A43Q9HB55 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CYP3A43Q9HB55 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CYP3A43Q9HB55 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CYP3A43Q9HB55 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CYP3A43Q9HB55 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CYP3A43Q9HB55 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CYP3A43Q9HB55 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CYP3A43Q9HB55 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYP3A43Q9HB55 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYP3A43Q9HB55 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP3A43Q9HB55 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP3A43Q9HB55 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP3A43Q9HB55 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP3A43Q9HB55 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYP3A43Q9HB55 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYP3A43Q9HB55 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYP3A43Q9HB55 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYP3A43Q9HB55 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYP3A43Q9HB55 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYP3A43Q9HB55 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYP3A43Q9HB55 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CYP3A43Q9HB55 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYP3A43Q9HB55 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYP3A43Q9HB55 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CYP3A43Q9HB55 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYP3A43Q9HB55 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYP3A43Q9HB55 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYP3A43Q9HB55 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYP3A43Q9HB55 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYP3A43Q9HB55 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYP3A43Q9HB55 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CYP3A43Q9HB55 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYP3A43Q9HB55 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYP3A43Q9HB55 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYP3A43Q9HB55 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYP3A43Q9HB55 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYP3A43Q9HB55 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYP3A43Q9HB55 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYP3A43Q9HB55 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYP3A43Q9HB55 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYP3A43Q9HB55 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYP3A43Q9HB55 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CYP3A43Q9HB55 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYP3A43Q9HB55 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYP3A43Q9HB55 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYP3A43Q9HB55 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CYP3A43Q9HB55 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYP3A43Q9HB55 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CYP3A43Q9HB55 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYP3A43Q9HB55 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CYP3A43Q9HB55 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYP3A43Q9HB55 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYP3A43Q9HB55 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYP3A43Q9HB55 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CYP3A43Q9HB55 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYP3A43Q9HB55 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CYP3A43Q9HB55 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CYP3A43Q9HB55 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CYP3A43Q9HB55 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CYP3A43Q9HB55 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CYP3A43Q9HB55 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYP3A43Q9HB55 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYP3A43Q9HB55 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYP3A43Q9HB55 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYP3A43Q9HB55 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYP3A43Q9HB55 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYP3A43Q9HB55 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYP3A43Q9HB55 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYP3A43Q9HB55 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYP3A43Q9HB55 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYP3A43Q9HB55 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYP3A43Q9HB55 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYP3A43Q9HB55 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYP3A43Q9HB55 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYP3A43Q9HB55 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYP3A43Q9HB55 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CYP3A43Q9HB55 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYP3A43Q9HB55 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYP3A43Q9HB55 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYP3A43Q9HB55 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYP3A43Q9HB55 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYP3A43Q9HB55 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYP3A43Q9HB55 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms