Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y6

POLR1B, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1BQ9H9Y6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR1BQ9H9Y6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR1BQ9H9Y6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR1BQ9H9Y6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR1BQ9H9Y6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR1BQ9H9Y6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR1BQ9H9Y6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR1BQ9H9Y6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR1BQ9H9Y6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR1BQ9H9Y6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR1BQ9H9Y6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR1BQ9H9Y6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR1BQ9H9Y6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR1BQ9H9Y6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR1BQ9H9Y6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR1BQ9H9Y6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR1BQ9H9Y6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR1BQ9H9Y6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR1BQ9H9Y6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR1BQ9H9Y6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR1BQ9H9Y6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR1BQ9H9Y6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR1BQ9H9Y6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR1BQ9H9Y6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
POLR1BQ9H9Y6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
POLR1BQ9H9Y6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR1BQ9H9Y6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR1BQ9H9Y6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR1BQ9H9Y6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR1BQ9H9Y6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR1BQ9H9Y6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR1BQ9H9Y6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR1BQ9H9Y6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR1BQ9H9Y6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR1BQ9H9Y6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR1BQ9H9Y6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR1BQ9H9Y6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR1BQ9H9Y6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR1BQ9H9Y6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR1BQ9H9Y6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1BQ9H9Y6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1BQ9H9Y6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1BQ9H9Y6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1BQ9H9Y6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1BQ9H9Y6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1BQ9H9Y6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1BQ9H9Y6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR1BQ9H9Y6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR1BQ9H9Y6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR1BQ9H9Y6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR1BQ9H9Y6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR1BQ9H9Y6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR1BQ9H9Y6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR1BQ9H9Y6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR1BQ9H9Y6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR1BQ9H9Y6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR1BQ9H9Y6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR1BQ9H9Y6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR1BQ9H9Y6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR1BQ9H9Y6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR1BQ9H9Y6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR1BQ9H9Y6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR1BQ9H9Y6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR1BQ9H9Y6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR1BQ9H9Y6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR1BQ9H9Y6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR1BQ9H9Y6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR1BQ9H9Y6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR1BQ9H9Y6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR1BQ9H9Y6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR1BQ9H9Y6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR1BQ9H9Y6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR1BQ9H9Y6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR1BQ9H9Y6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR1BQ9H9Y6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR1BQ9H9Y6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR1BQ9H9Y6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR1BQ9H9Y6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR1BQ9H9Y6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR1BQ9H9Y6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR1BQ9H9Y6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR1BQ9H9Y6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR1BQ9H9Y6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR1BQ9H9Y6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR1BQ9H9Y6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR1BQ9H9Y6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR1BQ9H9Y6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR1BQ9H9Y6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR1BQ9H9Y6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR1BQ9H9Y6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR1BQ9H9Y6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR1BQ9H9Y6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1BQ9H9Y6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1BQ9H9Y6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1BQ9H9Y6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1BQ9H9Y6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1BQ9H9Y6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1BQ9H9Y6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1BQ9H9Y6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1BQ9H9Y6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms