Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7U1

CCSER2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER2Q9H7U1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCSER2Q9H7U1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCSER2Q9H7U1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCSER2Q9H7U1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCSER2Q9H7U1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCSER2Q9H7U1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCSER2Q9H7U1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCSER2Q9H7U1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCSER2Q9H7U1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCSER2Q9H7U1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCSER2Q9H7U1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCSER2Q9H7U1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCSER2Q9H7U1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCSER2Q9H7U1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCSER2Q9H7U1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCSER2Q9H7U1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCSER2Q9H7U1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCSER2Q9H7U1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCSER2Q9H7U1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCSER2Q9H7U1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCSER2Q9H7U1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCSER2Q9H7U1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCSER2Q9H7U1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCSER2Q9H7U1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCSER2Q9H7U1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCSER2Q9H7U1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCSER2Q9H7U1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCSER2Q9H7U1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCSER2Q9H7U1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCSER2Q9H7U1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCSER2Q9H7U1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCSER2Q9H7U1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCSER2Q9H7U1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCSER2Q9H7U1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCSER2Q9H7U1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCSER2Q9H7U1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCSER2Q9H7U1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCSER2Q9H7U1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCSER2Q9H7U1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCSER2Q9H7U1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCSER2Q9H7U1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCSER2Q9H7U1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCSER2Q9H7U1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCSER2Q9H7U1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCSER2Q9H7U1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCSER2Q9H7U1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCSER2Q9H7U1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCSER2Q9H7U1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCSER2Q9H7U1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCSER2Q9H7U1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCSER2Q9H7U1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCSER2Q9H7U1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCSER2Q9H7U1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCSER2Q9H7U1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCSER2Q9H7U1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCSER2Q9H7U1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCSER2Q9H7U1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCSER2Q9H7U1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCSER2Q9H7U1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCSER2Q9H7U1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCSER2Q9H7U1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCSER2Q9H7U1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCSER2Q9H7U1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCSER2Q9H7U1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCSER2Q9H7U1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCSER2Q9H7U1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCSER2Q9H7U1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCSER2Q9H7U1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCSER2Q9H7U1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCSER2Q9H7U1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCSER2Q9H7U1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCSER2Q9H7U1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCSER2Q9H7U1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCSER2Q9H7U1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCSER2Q9H7U1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCSER2Q9H7U1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCSER2Q9H7U1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCSER2Q9H7U1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCSER2Q9H7U1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCSER2Q9H7U1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCSER2Q9H7U1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCSER2Q9H7U1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCSER2Q9H7U1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCSER2Q9H7U1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCSER2Q9H7U1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCSER2Q9H7U1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCSER2Q9H7U1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCSER2Q9H7U1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCSER2Q9H7U1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCSER2Q9H7U1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCSER2Q9H7U1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCSER2Q9H7U1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCSER2Q9H7U1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCSER2Q9H7U1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCSER2Q9H7U1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCSER2Q9H7U1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCSER2Q9H7U1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCSER2Q9H7U1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCSER2Q9H7U1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCSER2Q9H7U1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
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