Protein–RNA interactions for Protein: Q9H790

EXO5, Exonuclease V, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXO5Q9H790 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXO5Q9H790 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXO5Q9H790 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXO5Q9H790 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXO5Q9H790 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXO5Q9H790 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EXO5Q9H790 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXO5Q9H790 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EXO5Q9H790 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXO5Q9H790 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXO5Q9H790 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXO5Q9H790 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXO5Q9H790 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXO5Q9H790 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXO5Q9H790 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXO5Q9H790 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EXO5Q9H790 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXO5Q9H790 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EXO5Q9H790 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EXO5Q9H790 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EXO5Q9H790 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXO5Q9H790 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXO5Q9H790 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXO5Q9H790 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXO5Q9H790 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXO5Q9H790 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXO5Q9H790 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXO5Q9H790 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXO5Q9H790 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXO5Q9H790 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXO5Q9H790 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXO5Q9H790 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXO5Q9H790 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXO5Q9H790 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXO5Q9H790 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXO5Q9H790 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXO5Q9H790 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXO5Q9H790 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXO5Q9H790 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXO5Q9H790 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXO5Q9H790 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXO5Q9H790 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXO5Q9H790 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXO5Q9H790 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXO5Q9H790 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXO5Q9H790 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXO5Q9H790 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXO5Q9H790 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXO5Q9H790 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXO5Q9H790 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXO5Q9H790 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXO5Q9H790 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXO5Q9H790 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXO5Q9H790 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXO5Q9H790 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXO5Q9H790 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EXO5Q9H790 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXO5Q9H790 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXO5Q9H790 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXO5Q9H790 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXO5Q9H790 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EXO5Q9H790 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXO5Q9H790 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXO5Q9H790 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXO5Q9H790 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXO5Q9H790 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXO5Q9H790 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EXO5Q9H790 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXO5Q9H790 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXO5Q9H790 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EXO5Q9H790 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXO5Q9H790 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXO5Q9H790 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXO5Q9H790 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXO5Q9H790 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXO5Q9H790 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EXO5Q9H790 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXO5Q9H790 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXO5Q9H790 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXO5Q9H790 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXO5Q9H790 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXO5Q9H790 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXO5Q9H790 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXO5Q9H790 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXO5Q9H790 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXO5Q9H790 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
EXO5Q9H790 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXO5Q9H790 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXO5Q9H790 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXO5Q9H790 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXO5Q9H790 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXO5Q9H790 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXO5Q9H790 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXO5Q9H790 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EXO5Q9H790 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXO5Q9H790 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXO5Q9H790 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXO5Q9H790 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXO5Q9H790 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXO5Q9H790 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms