Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6W3

RIOX1, Ribosomal oxygenase 1, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOX1Q9H6W3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RIOX1Q9H6W3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RIOX1Q9H6W3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RIOX1Q9H6W3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RIOX1Q9H6W3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RIOX1Q9H6W3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RIOX1Q9H6W3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RIOX1Q9H6W3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RIOX1Q9H6W3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RIOX1Q9H6W3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RIOX1Q9H6W3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RIOX1Q9H6W3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RIOX1Q9H6W3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RIOX1Q9H6W3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RIOX1Q9H6W3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RIOX1Q9H6W3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RIOX1Q9H6W3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RIOX1Q9H6W3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RIOX1Q9H6W3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RIOX1Q9H6W3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RIOX1Q9H6W3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
RIOX1Q9H6W3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RIOX1Q9H6W3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RIOX1Q9H6W3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RIOX1Q9H6W3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
RIOX1Q9H6W3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RIOX1Q9H6W3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
RIOX1Q9H6W3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RIOX1Q9H6W3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RIOX1Q9H6W3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RIOX1Q9H6W3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RIOX1Q9H6W3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RIOX1Q9H6W3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RIOX1Q9H6W3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RIOX1Q9H6W3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RIOX1Q9H6W3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RIOX1Q9H6W3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RIOX1Q9H6W3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RIOX1Q9H6W3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RIOX1Q9H6W3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RIOX1Q9H6W3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RIOX1Q9H6W3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RIOX1Q9H6W3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RIOX1Q9H6W3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RIOX1Q9H6W3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RIOX1Q9H6W3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RIOX1Q9H6W3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RIOX1Q9H6W3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RIOX1Q9H6W3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RIOX1Q9H6W3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RIOX1Q9H6W3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RIOX1Q9H6W3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RIOX1Q9H6W3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RIOX1Q9H6W3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RIOX1Q9H6W3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RIOX1Q9H6W3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RIOX1Q9H6W3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RIOX1Q9H6W3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RIOX1Q9H6W3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RIOX1Q9H6W3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RIOX1Q9H6W3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RIOX1Q9H6W3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RIOX1Q9H6W3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RIOX1Q9H6W3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RIOX1Q9H6W3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RIOX1Q9H6W3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RIOX1Q9H6W3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RIOX1Q9H6W3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RIOX1Q9H6W3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RIOX1Q9H6W3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RIOX1Q9H6W3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RIOX1Q9H6W3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RIOX1Q9H6W3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RIOX1Q9H6W3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RIOX1Q9H6W3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RIOX1Q9H6W3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RIOX1Q9H6W3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RIOX1Q9H6W3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RIOX1Q9H6W3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RIOX1Q9H6W3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RIOX1Q9H6W3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RIOX1Q9H6W3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RIOX1Q9H6W3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RIOX1Q9H6W3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RIOX1Q9H6W3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RIOX1Q9H6W3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RIOX1Q9H6W3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RIOX1Q9H6W3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RIOX1Q9H6W3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RIOX1Q9H6W3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RIOX1Q9H6W3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RIOX1Q9H6W3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RIOX1Q9H6W3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
RIOX1Q9H6W3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RIOX1Q9H6W3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RIOX1Q9H6W3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RIOX1Q9H6W3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RIOX1Q9H6W3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RIOX1Q9H6W3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RIOX1Q9H6W3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 486.1 ms