Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6K4

OPA3, Optic atrophy 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPA3Q9H6K4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OPA3Q9H6K4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OPA3Q9H6K4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OPA3Q9H6K4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OPA3Q9H6K4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OPA3Q9H6K4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
OPA3Q9H6K4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OPA3Q9H6K4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OPA3Q9H6K4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OPA3Q9H6K4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
OPA3Q9H6K4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.32■■□□□ 1
OPA3Q9H6K4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OPA3Q9H6K4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OPA3Q9H6K4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.31■■□□□ 1
OPA3Q9H6K4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OPA3Q9H6K4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
OPA3Q9H6K4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OPA3Q9H6K4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OPA3Q9H6K4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OPA3Q9H6K4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
OPA3Q9H6K4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OPA3Q9H6K4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
OPA3Q9H6K4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.3■■□□□ 1
OPA3Q9H6K4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OPA3Q9H6K4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OPA3Q9H6K4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
OPA3Q9H6K4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
OPA3Q9H6K4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.29■■□□□ 1
OPA3Q9H6K4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OPA3Q9H6K4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OPA3Q9H6K4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
OPA3Q9H6K4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
OPA3Q9H6K4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OPA3Q9H6K4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OPA3Q9H6K4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
OPA3Q9H6K4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OPA3Q9H6K4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OPA3Q9H6K4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OPA3Q9H6K4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
OPA3Q9H6K4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OPA3Q9H6K4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OPA3Q9H6K4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OPA3Q9H6K4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OPA3Q9H6K4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
OPA3Q9H6K4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
OPA3Q9H6K4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OPA3Q9H6K4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OPA3Q9H6K4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OPA3Q9H6K4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OPA3Q9H6K4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OPA3Q9H6K4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OPA3Q9H6K4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OPA3Q9H6K4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OPA3Q9H6K4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OPA3Q9H6K4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OPA3Q9H6K4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OPA3Q9H6K4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OPA3Q9H6K4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OPA3Q9H6K4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OPA3Q9H6K4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OPA3Q9H6K4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OPA3Q9H6K4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OPA3Q9H6K4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OPA3Q9H6K4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OPA3Q9H6K4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OPA3Q9H6K4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
OPA3Q9H6K4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OPA3Q9H6K4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OPA3Q9H6K4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OPA3Q9H6K4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
OPA3Q9H6K4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OPA3Q9H6K4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OPA3Q9H6K4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OPA3Q9H6K4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OPA3Q9H6K4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OPA3Q9H6K4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OPA3Q9H6K4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OPA3Q9H6K4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OPA3Q9H6K4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OPA3Q9H6K4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OPA3Q9H6K4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OPA3Q9H6K4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms