Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T3

SEMA6B, Semaphorin-6B, humanhuman

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6BQ9H3T3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEMA6BQ9H3T3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEMA6BQ9H3T3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEMA6BQ9H3T3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SEMA6BQ9H3T3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEMA6BQ9H3T3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEMA6BQ9H3T3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEMA6BQ9H3T3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEMA6BQ9H3T3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEMA6BQ9H3T3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEMA6BQ9H3T3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEMA6BQ9H3T3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEMA6BQ9H3T3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEMA6BQ9H3T3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEMA6BQ9H3T3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEMA6BQ9H3T3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEMA6BQ9H3T3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28■■■□□ 2.07
SEMA6BQ9H3T3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SEMA6BQ9H3T3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SEMA6BQ9H3T3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEMA6BQ9H3T3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SEMA6BQ9H3T3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEMA6BQ9H3T3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEMA6BQ9H3T3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SEMA6BQ9H3T3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SEMA6BQ9H3T3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SEMA6BQ9H3T3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEMA6BQ9H3T3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEMA6BQ9H3T3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEMA6BQ9H3T3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEMA6BQ9H3T3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEMA6BQ9H3T3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEMA6BQ9H3T3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEMA6BQ9H3T3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEMA6BQ9H3T3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEMA6BQ9H3T3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEMA6BQ9H3T3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEMA6BQ9H3T3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEMA6BQ9H3T3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEMA6BQ9H3T3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEMA6BQ9H3T3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEMA6BQ9H3T3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEMA6BQ9H3T3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEMA6BQ9H3T3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEMA6BQ9H3T3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEMA6BQ9H3T3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEMA6BQ9H3T3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEMA6BQ9H3T3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEMA6BQ9H3T3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEMA6BQ9H3T3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEMA6BQ9H3T3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEMA6BQ9H3T3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEMA6BQ9H3T3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEMA6BQ9H3T3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEMA6BQ9H3T3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEMA6BQ9H3T3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEMA6BQ9H3T3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEMA6BQ9H3T3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEMA6BQ9H3T3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEMA6BQ9H3T3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEMA6BQ9H3T3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEMA6BQ9H3T3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEMA6BQ9H3T3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEMA6BQ9H3T3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEMA6BQ9H3T3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEMA6BQ9H3T3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEMA6BQ9H3T3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SEMA6BQ9H3T3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEMA6BQ9H3T3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEMA6BQ9H3T3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEMA6BQ9H3T3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEMA6BQ9H3T3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEMA6BQ9H3T3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEMA6BQ9H3T3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEMA6BQ9H3T3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SEMA6BQ9H3T3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SEMA6BQ9H3T3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEMA6BQ9H3T3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEMA6BQ9H3T3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEMA6BQ9H3T3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEMA6BQ9H3T3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEMA6BQ9H3T3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEMA6BQ9H3T3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEMA6BQ9H3T3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SEMA6BQ9H3T3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEMA6BQ9H3T3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEMA6BQ9H3T3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEMA6BQ9H3T3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEMA6BQ9H3T3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SEMA6BQ9H3T3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEMA6BQ9H3T3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEMA6BQ9H3T3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEMA6BQ9H3T3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEMA6BQ9H3T3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEMA6BQ9H3T3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEMA6BQ9H3T3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEMA6BQ9H3T3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEMA6BQ9H3T3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEMA6BQ9H3T3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEMA6BQ9H3T3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.2 ms