Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MCOLN1Q9GZU1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MCOLN1Q9GZU1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MCOLN1Q9GZU1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
MCOLN1Q9GZU1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MCOLN1Q9GZU1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MCOLN1Q9GZU1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MCOLN1Q9GZU1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MCOLN1Q9GZU1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MCOLN1Q9GZU1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
MCOLN1Q9GZU1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MCOLN1Q9GZU1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
MCOLN1Q9GZU1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MCOLN1Q9GZU1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MCOLN1Q9GZU1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
MCOLN1Q9GZU1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
MCOLN1Q9GZU1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MCOLN1Q9GZU1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
MCOLN1Q9GZU1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MCOLN1Q9GZU1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MCOLN1Q9GZU1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MCOLN1Q9GZU1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MCOLN1Q9GZU1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MCOLN1Q9GZU1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MCOLN1Q9GZU1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MCOLN1Q9GZU1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
MCOLN1Q9GZU1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MCOLN1Q9GZU1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MCOLN1Q9GZU1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MCOLN1Q9GZU1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MCOLN1Q9GZU1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MCOLN1Q9GZU1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MCOLN1Q9GZU1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MCOLN1Q9GZU1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MCOLN1Q9GZU1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MCOLN1Q9GZU1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MCOLN1Q9GZU1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MCOLN1Q9GZU1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MCOLN1Q9GZU1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MCOLN1Q9GZU1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MCOLN1Q9GZU1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MCOLN1Q9GZU1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MCOLN1Q9GZU1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MCOLN1Q9GZU1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
MCOLN1Q9GZU1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MCOLN1Q9GZU1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MCOLN1Q9GZU1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MCOLN1Q9GZU1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MCOLN1Q9GZU1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MCOLN1Q9GZU1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MCOLN1Q9GZU1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCOLN1Q9GZU1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCOLN1Q9GZU1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCOLN1Q9GZU1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCOLN1Q9GZU1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCOLN1Q9GZU1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCOLN1Q9GZU1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MCOLN1Q9GZU1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
MCOLN1Q9GZU1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MCOLN1Q9GZU1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
MCOLN1Q9GZU1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MCOLN1Q9GZU1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
MCOLN1Q9GZU1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MCOLN1Q9GZU1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
MCOLN1Q9GZU1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MCOLN1Q9GZU1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MCOLN1Q9GZU1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MCOLN1Q9GZU1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MCOLN1Q9GZU1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MCOLN1Q9GZU1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MCOLN1Q9GZU1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MCOLN1Q9GZU1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCOLN1Q9GZU1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCOLN1Q9GZU1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCOLN1Q9GZU1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCOLN1Q9GZU1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
MCOLN1Q9GZU1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
MCOLN1Q9GZU1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCOLN1Q9GZU1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCOLN1Q9GZU1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCOLN1Q9GZU1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCOLN1Q9GZU1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCOLN1Q9GZU1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCOLN1Q9GZU1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCOLN1Q9GZU1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCOLN1Q9GZU1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCOLN1Q9GZU1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCOLN1Q9GZU1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCOLN1Q9GZU1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCOLN1Q9GZU1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCOLN1Q9GZU1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCOLN1Q9GZU1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MCOLN1Q9GZU1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MCOLN1Q9GZU1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MCOLN1Q9GZU1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MCOLN1Q9GZU1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MCOLN1Q9GZU1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MCOLN1Q9GZU1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MCOLN1Q9GZU1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MCOLN1Q9GZU1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms