Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
UBE2OQ9C0C9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
UBE2OQ9C0C9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBE2OQ9C0C9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBE2OQ9C0C9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.56■■■□□ 2
UBE2OQ9C0C9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.55■■■□□ 2
UBE2OQ9C0C9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
UBE2OQ9C0C9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
UBE2OQ9C0C9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBE2OQ9C0C9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UBE2OQ9C0C9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UBE2OQ9C0C9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UBE2OQ9C0C9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
UBE2OQ9C0C9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBE2OQ9C0C9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
UBE2OQ9C0C9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBE2OQ9C0C9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UBE2OQ9C0C9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
UBE2OQ9C0C9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.52■■■□□ 2
UBE2OQ9C0C9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.52■■■□□ 2
UBE2OQ9C0C9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
UBE2OQ9C0C9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
UBE2OQ9C0C9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UBE2OQ9C0C9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
UBE2OQ9C0C9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
UBE2OQ9C0C9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBE2OQ9C0C9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBE2OQ9C0C9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBE2OQ9C0C9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBE2OQ9C0C9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
UBE2OQ9C0C9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBE2OQ9C0C9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBE2OQ9C0C9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBE2OQ9C0C9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBE2OQ9C0C9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBE2OQ9C0C9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBE2OQ9C0C9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBE2OQ9C0C9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBE2OQ9C0C9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBE2OQ9C0C9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBE2OQ9C0C9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE2OQ9C0C9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE2OQ9C0C9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE2OQ9C0C9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE2OQ9C0C9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE2OQ9C0C9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE2OQ9C0C9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBE2OQ9C0C9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBE2OQ9C0C9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
UBE2OQ9C0C9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBE2OQ9C0C9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE2OQ9C0C9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE2OQ9C0C9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE2OQ9C0C9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE2OQ9C0C9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE2OQ9C0C9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE2OQ9C0C9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE2OQ9C0C9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE2OQ9C0C9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE2OQ9C0C9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE2OQ9C0C9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE2OQ9C0C9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE2OQ9C0C9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE2OQ9C0C9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE2OQ9C0C9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE2OQ9C0C9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE2OQ9C0C9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE2OQ9C0C9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE2OQ9C0C9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE2OQ9C0C9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE2OQ9C0C9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE2OQ9C0C9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE2OQ9C0C9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE2OQ9C0C9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBE2OQ9C0C9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBE2OQ9C0C9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBE2OQ9C0C9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
UBE2OQ9C0C9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE2OQ9C0C9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE2OQ9C0C9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE2OQ9C0C9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE2OQ9C0C9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE2OQ9C0C9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE2OQ9C0C9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE2OQ9C0C9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE2OQ9C0C9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE2OQ9C0C9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE2OQ9C0C9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE2OQ9C0C9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE2OQ9C0C9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE2OQ9C0C9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE2OQ9C0C9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE2OQ9C0C9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE2OQ9C0C9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE2OQ9C0C9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE2OQ9C0C9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE2OQ9C0C9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE2OQ9C0C9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBE2OQ9C0C9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBE2OQ9C0C9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms