Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXP3Q9BZS1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXP3Q9BZS1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXP3Q9BZS1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXP3Q9BZS1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXP3Q9BZS1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXP3Q9BZS1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FOXP3Q9BZS1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOXP3Q9BZS1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXP3Q9BZS1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXP3Q9BZS1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXP3Q9BZS1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXP3Q9BZS1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXP3Q9BZS1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXP3Q9BZS1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXP3Q9BZS1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXP3Q9BZS1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXP3Q9BZS1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXP3Q9BZS1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXP3Q9BZS1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXP3Q9BZS1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXP3Q9BZS1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXP3Q9BZS1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXP3Q9BZS1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXP3Q9BZS1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXP3Q9BZS1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXP3Q9BZS1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXP3Q9BZS1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FOXP3Q9BZS1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FOXP3Q9BZS1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FOXP3Q9BZS1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXP3Q9BZS1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXP3Q9BZS1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXP3Q9BZS1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXP3Q9BZS1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXP3Q9BZS1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXP3Q9BZS1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXP3Q9BZS1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXP3Q9BZS1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXP3Q9BZS1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXP3Q9BZS1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXP3Q9BZS1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXP3Q9BZS1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXP3Q9BZS1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXP3Q9BZS1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXP3Q9BZS1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXP3Q9BZS1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXP3Q9BZS1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXP3Q9BZS1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXP3Q9BZS1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXP3Q9BZS1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXP3Q9BZS1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXP3Q9BZS1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXP3Q9BZS1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXP3Q9BZS1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXP3Q9BZS1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXP3Q9BZS1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXP3Q9BZS1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FOXP3Q9BZS1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXP3Q9BZS1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXP3Q9BZS1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXP3Q9BZS1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXP3Q9BZS1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXP3Q9BZS1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXP3Q9BZS1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXP3Q9BZS1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXP3Q9BZS1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXP3Q9BZS1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXP3Q9BZS1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXP3Q9BZS1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXP3Q9BZS1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXP3Q9BZS1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXP3Q9BZS1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXP3Q9BZS1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXP3Q9BZS1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXP3Q9BZS1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXP3Q9BZS1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXP3Q9BZS1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXP3Q9BZS1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXP3Q9BZS1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXP3Q9BZS1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXP3Q9BZS1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXP3Q9BZS1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXP3Q9BZS1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXP3Q9BZS1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXP3Q9BZS1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXP3Q9BZS1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXP3Q9BZS1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXP3Q9BZS1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXP3Q9BZS1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXP3Q9BZS1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXP3Q9BZS1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXP3Q9BZS1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXP3Q9BZS1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXP3Q9BZS1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXP3Q9BZS1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXP3Q9BZS1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXP3Q9BZS1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXP3Q9BZS1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXP3Q9BZS1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms