Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC3Q9BY71 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC3Q9BY71 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC3Q9BY71 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC3Q9BY71 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC3Q9BY71 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC3Q9BY71 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC3Q9BY71 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC3Q9BY71 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC3Q9BY71 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC3Q9BY71 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC3Q9BY71 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC3Q9BY71 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC3Q9BY71 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC3Q9BY71 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC3Q9BY71 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC3Q9BY71 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC3Q9BY71 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC3Q9BY71 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC3Q9BY71 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC3Q9BY71 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LRRC3Q9BY71 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC3Q9BY71 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC3Q9BY71 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC3Q9BY71 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC3Q9BY71 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC3Q9BY71 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC3Q9BY71 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC3Q9BY71 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC3Q9BY71 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC3Q9BY71 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC3Q9BY71 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC3Q9BY71 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC3Q9BY71 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC3Q9BY71 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC3Q9BY71 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC3Q9BY71 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC3Q9BY71 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC3Q9BY71 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC3Q9BY71 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRRC3Q9BY71 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRRC3Q9BY71 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRRC3Q9BY71 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC3Q9BY71 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC3Q9BY71 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC3Q9BY71 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC3Q9BY71 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC3Q9BY71 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC3Q9BY71 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC3Q9BY71 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC3Q9BY71 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC3Q9BY71 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC3Q9BY71 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC3Q9BY71 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC3Q9BY71 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC3Q9BY71 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC3Q9BY71 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC3Q9BY71 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC3Q9BY71 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC3Q9BY71 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC3Q9BY71 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC3Q9BY71 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC3Q9BY71 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC3Q9BY71 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC3Q9BY71 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC3Q9BY71 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC3Q9BY71 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC3Q9BY71 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC3Q9BY71 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC3Q9BY71 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC3Q9BY71 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC3Q9BY71 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC3Q9BY71 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC3Q9BY71 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC3Q9BY71 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC3Q9BY71 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC3Q9BY71 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRRC3Q9BY71 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRRC3Q9BY71 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC3Q9BY71 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC3Q9BY71 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC3Q9BY71 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC3Q9BY71 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC3Q9BY71 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC3Q9BY71 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC3Q9BY71 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC3Q9BY71 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC3Q9BY71 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC3Q9BY71 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC3Q9BY71 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC3Q9BY71 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC3Q9BY71 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC3Q9BY71 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC3Q9BY71 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC3Q9BY71 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC3Q9BY71 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC3Q9BY71 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC3Q9BY71 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC3Q9BY71 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC3Q9BY71 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms