Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC43.42■■■■■ 4.54
FANCD2Q9BXW9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC43.42■■■■■ 4.54
FANCD2Q9BXW9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
FANCD2Q9BXW9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
FANCD2Q9BXW9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
FANCD2Q9BXW9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC43.39■■■■■ 4.54
FANCD2Q9BXW9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
FANCD2Q9BXW9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC43.39■■■■■ 4.54
FANCD2Q9BXW9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.53
FANCD2Q9BXW9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.53
FANCD2Q9BXW9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC43.37■■■■■ 4.53
FANCD2Q9BXW9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
FANCD2Q9BXW9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC43.36■■■■■ 4.53
FANCD2Q9BXW9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.36■■■■■ 4.53
FANCD2Q9BXW9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC43.36■■■■■ 4.53
FANCD2Q9BXW9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC43.35■■■■■ 4.53
FANCD2Q9BXW9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
FANCD2Q9BXW9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
FANCD2Q9BXW9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC43.35■■■■■ 4.53
FANCD2Q9BXW9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
FANCD2Q9BXW9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
FANCD2Q9BXW9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC43.34■■■■■ 4.53
FANCD2Q9BXW9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
FANCD2Q9BXW9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC43.33■■■■■ 4.53
FANCD2Q9BXW9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.33■■■■■ 4.53
FANCD2Q9BXW9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC43.32■■■■■ 4.53
FANCD2Q9BXW9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
FANCD2Q9BXW9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC43.32■■■■■ 4.52
FANCD2Q9BXW9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
FANCD2Q9BXW9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
FANCD2Q9BXW9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
FANCD2Q9BXW9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC43.29■■■■■ 4.52
FANCD2Q9BXW9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC43.29■■■■■ 4.52
FANCD2Q9BXW9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
FANCD2Q9BXW9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC43.28■■■■■ 4.52
FANCD2Q9BXW9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC43.27■■■■■ 4.52
FANCD2Q9BXW9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
FANCD2Q9BXW9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.25■■■■■ 4.51
FANCD2Q9BXW9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
FANCD2Q9BXW9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
FANCD2Q9BXW9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
FANCD2Q9BXW9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
FANCD2Q9BXW9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.23■■■■■ 4.51
FANCD2Q9BXW9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
FANCD2Q9BXW9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC43.22■■■■■ 4.51
FANCD2Q9BXW9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC43.22■■■■■ 4.51
FANCD2Q9BXW9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
FANCD2Q9BXW9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
FANCD2Q9BXW9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC43.2■■■■■ 4.51
FANCD2Q9BXW9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
FANCD2Q9BXW9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC43.19■■■■■ 4.5
FANCD2Q9BXW9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
FANCD2Q9BXW9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
FANCD2Q9BXW9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
FANCD2Q9BXW9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
FANCD2Q9BXW9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
FANCD2Q9BXW9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC43.17■■■■■ 4.5
FANCD2Q9BXW9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC43.16■■■■■ 4.5
FANCD2Q9BXW9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC43.15■■■■■ 4.5
FANCD2Q9BXW9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
FANCD2Q9BXW9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
FANCD2Q9BXW9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
FANCD2Q9BXW9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC43.13■■■■■ 4.49
FANCD2Q9BXW9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
FANCD2Q9BXW9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC43.12■■■■■ 4.49
FANCD2Q9BXW9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC43.11■■■■■ 4.49
FANCD2Q9BXW9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
FANCD2Q9BXW9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC43.11■■■■■ 4.49
FANCD2Q9BXW9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
FANCD2Q9BXW9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
FANCD2Q9BXW9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC43.09■■■■■ 4.49
FANCD2Q9BXW9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
FANCD2Q9BXW9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
FANCD2Q9BXW9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC43.08■■■■■ 4.49
FANCD2Q9BXW9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.49
FANCD2Q9BXW9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC43.07■■■■■ 4.49
FANCD2Q9BXW9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
FANCD2Q9BXW9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
FANCD2Q9BXW9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC43.06■■■■■ 4.48
FANCD2Q9BXW9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
FANCD2Q9BXW9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC43.06■■■■■ 4.48
FANCD2Q9BXW9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
FANCD2Q9BXW9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC43.05■■■■■ 4.48
FANCD2Q9BXW9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC43.04■■■■■ 4.48
FANCD2Q9BXW9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
FANCD2Q9BXW9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC43.03■■■■■ 4.48
FANCD2Q9BXW9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
FANCD2Q9BXW9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC43.03■■■■■ 4.48
FANCD2Q9BXW9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC43.02■■■■■ 4.48
FANCD2Q9BXW9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
FANCD2Q9BXW9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC43.01■■■■■ 4.48
FANCD2Q9BXW9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC43■■■■■ 4.47
FANCD2Q9BXW9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43■■■■■ 4.47
FANCD2Q9BXW9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
FANCD2Q9BXW9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC42.99■■■■■ 4.47
FANCD2Q9BXW9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
FANCD2Q9BXW9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
FANCD2Q9BXW9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
FANCD2Q9BXW9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC42.97■■■■■ 4.47
FANCD2Q9BXW9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC42.97■■■■■ 4.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms