Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC0

HCAR1, Hydroxycarboxylic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCAR1Q9BXC0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HCAR1Q9BXC0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HCAR1Q9BXC0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HCAR1Q9BXC0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HCAR1Q9BXC0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HCAR1Q9BXC0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HCAR1Q9BXC0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HCAR1Q9BXC0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCAR1Q9BXC0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCAR1Q9BXC0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCAR1Q9BXC0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCAR1Q9BXC0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCAR1Q9BXC0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCAR1Q9BXC0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HCAR1Q9BXC0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HCAR1Q9BXC0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HCAR1Q9BXC0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HCAR1Q9BXC0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HCAR1Q9BXC0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HCAR1Q9BXC0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HCAR1Q9BXC0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCAR1Q9BXC0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCAR1Q9BXC0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCAR1Q9BXC0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCAR1Q9BXC0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCAR1Q9BXC0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HCAR1Q9BXC0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCAR1Q9BXC0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCAR1Q9BXC0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCAR1Q9BXC0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCAR1Q9BXC0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HCAR1Q9BXC0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCAR1Q9BXC0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCAR1Q9BXC0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCAR1Q9BXC0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCAR1Q9BXC0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCAR1Q9BXC0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCAR1Q9BXC0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCAR1Q9BXC0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCAR1Q9BXC0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCAR1Q9BXC0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCAR1Q9BXC0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCAR1Q9BXC0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCAR1Q9BXC0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCAR1Q9BXC0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCAR1Q9BXC0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCAR1Q9BXC0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCAR1Q9BXC0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCAR1Q9BXC0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCAR1Q9BXC0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCAR1Q9BXC0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCAR1Q9BXC0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCAR1Q9BXC0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCAR1Q9BXC0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HCAR1Q9BXC0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCAR1Q9BXC0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCAR1Q9BXC0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCAR1Q9BXC0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCAR1Q9BXC0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCAR1Q9BXC0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCAR1Q9BXC0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCAR1Q9BXC0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCAR1Q9BXC0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCAR1Q9BXC0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCAR1Q9BXC0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCAR1Q9BXC0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCAR1Q9BXC0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCAR1Q9BXC0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCAR1Q9BXC0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HCAR1Q9BXC0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HCAR1Q9BXC0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HCAR1Q9BXC0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HCAR1Q9BXC0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HCAR1Q9BXC0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HCAR1Q9BXC0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HCAR1Q9BXC0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCAR1Q9BXC0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCAR1Q9BXC0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCAR1Q9BXC0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCAR1Q9BXC0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCAR1Q9BXC0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCAR1Q9BXC0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCAR1Q9BXC0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCAR1Q9BXC0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCAR1Q9BXC0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCAR1Q9BXC0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCAR1Q9BXC0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCAR1Q9BXC0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCAR1Q9BXC0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCAR1Q9BXC0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCAR1Q9BXC0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCAR1Q9BXC0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCAR1Q9BXC0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HCAR1Q9BXC0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HCAR1Q9BXC0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HCAR1Q9BXC0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HCAR1Q9BXC0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HCAR1Q9BXC0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HCAR1Q9BXC0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HCAR1Q9BXC0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms