Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUL5

PHF23, PHD finger protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF23Q9BUL5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PHF23Q9BUL5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
PHF23Q9BUL5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PHF23Q9BUL5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PHF23Q9BUL5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PHF23Q9BUL5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
PHF23Q9BUL5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PHF23Q9BUL5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PHF23Q9BUL5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PHF23Q9BUL5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PHF23Q9BUL5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PHF23Q9BUL5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PHF23Q9BUL5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PHF23Q9BUL5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PHF23Q9BUL5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
PHF23Q9BUL5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PHF23Q9BUL5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PHF23Q9BUL5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PHF23Q9BUL5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PHF23Q9BUL5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PHF23Q9BUL5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PHF23Q9BUL5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PHF23Q9BUL5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PHF23Q9BUL5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PHF23Q9BUL5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PHF23Q9BUL5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PHF23Q9BUL5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PHF23Q9BUL5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PHF23Q9BUL5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PHF23Q9BUL5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PHF23Q9BUL5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
PHF23Q9BUL5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PHF23Q9BUL5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
PHF23Q9BUL5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PHF23Q9BUL5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PHF23Q9BUL5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PHF23Q9BUL5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PHF23Q9BUL5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PHF23Q9BUL5 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
PHF23Q9BUL5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PHF23Q9BUL5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PHF23Q9BUL5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PHF23Q9BUL5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
PHF23Q9BUL5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PHF23Q9BUL5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PHF23Q9BUL5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
PHF23Q9BUL5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PHF23Q9BUL5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PHF23Q9BUL5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PHF23Q9BUL5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PHF23Q9BUL5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PHF23Q9BUL5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PHF23Q9BUL5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
PHF23Q9BUL5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
PHF23Q9BUL5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PHF23Q9BUL5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
PHF23Q9BUL5 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
PHF23Q9BUL5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
PHF23Q9BUL5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC34.82■■■■□ 3.17
PHF23Q9BUL5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PHF23Q9BUL5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC34.82■■■■□ 3.16
PHF23Q9BUL5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
PHF23Q9BUL5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PHF23Q9BUL5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PHF23Q9BUL5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PHF23Q9BUL5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PHF23Q9BUL5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PHF23Q9BUL5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PHF23Q9BUL5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PHF23Q9BUL5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PHF23Q9BUL5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PHF23Q9BUL5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PHF23Q9BUL5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PHF23Q9BUL5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PHF23Q9BUL5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PHF23Q9BUL5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PHF23Q9BUL5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PHF23Q9BUL5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PHF23Q9BUL5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PHF23Q9BUL5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
PHF23Q9BUL5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PHF23Q9BUL5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PHF23Q9BUL5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
PHF23Q9BUL5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PHF23Q9BUL5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PHF23Q9BUL5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PHF23Q9BUL5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PHF23Q9BUL5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
PHF23Q9BUL5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
PHF23Q9BUL5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
PHF23Q9BUL5 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
PHF23Q9BUL5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PHF23Q9BUL5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PHF23Q9BUL5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PHF23Q9BUL5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PHF23Q9BUL5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PHF23Q9BUL5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PHF23Q9BUL5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PHF23Q9BUL5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PHF23Q9BUL5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms