Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPOQ9BU64 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPOQ9BU64 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPOQ9BU64 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPOQ9BU64 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPOQ9BU64 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPOQ9BU64 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPOQ9BU64 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPOQ9BU64 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPOQ9BU64 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPOQ9BU64 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPOQ9BU64 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPOQ9BU64 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPOQ9BU64 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPOQ9BU64 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPOQ9BU64 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPOQ9BU64 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPOQ9BU64 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPOQ9BU64 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPOQ9BU64 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPOQ9BU64 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPOQ9BU64 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPOQ9BU64 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPOQ9BU64 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPOQ9BU64 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPOQ9BU64 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPOQ9BU64 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPOQ9BU64 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPOQ9BU64 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPOQ9BU64 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPOQ9BU64 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPOQ9BU64 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPOQ9BU64 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPOQ9BU64 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPOQ9BU64 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPOQ9BU64 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPOQ9BU64 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPOQ9BU64 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPOQ9BU64 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPOQ9BU64 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPOQ9BU64 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPOQ9BU64 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPOQ9BU64 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPOQ9BU64 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPOQ9BU64 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPOQ9BU64 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPOQ9BU64 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPOQ9BU64 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPOQ9BU64 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPOQ9BU64 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPOQ9BU64 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPOQ9BU64 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPOQ9BU64 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPOQ9BU64 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPOQ9BU64 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPOQ9BU64 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPOQ9BU64 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPOQ9BU64 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CENPOQ9BU64 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CENPOQ9BU64 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPOQ9BU64 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPOQ9BU64 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPOQ9BU64 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPOQ9BU64 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPOQ9BU64 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPOQ9BU64 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPOQ9BU64 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPOQ9BU64 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPOQ9BU64 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPOQ9BU64 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPOQ9BU64 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPOQ9BU64 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPOQ9BU64 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPOQ9BU64 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPOQ9BU64 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPOQ9BU64 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPOQ9BU64 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPOQ9BU64 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPOQ9BU64 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPOQ9BU64 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPOQ9BU64 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPOQ9BU64 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPOQ9BU64 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPOQ9BU64 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPOQ9BU64 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPOQ9BU64 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPOQ9BU64 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPOQ9BU64 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPOQ9BU64 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPOQ9BU64 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPOQ9BU64 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPOQ9BU64 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPOQ9BU64 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPOQ9BU64 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPOQ9BU64 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPOQ9BU64 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CENPOQ9BU64 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CENPOQ9BU64 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPOQ9BU64 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPOQ9BU64 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms