Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NDUFAF3Q9BU61 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NDUFAF3Q9BU61 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NDUFAF3Q9BU61 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NDUFAF3Q9BU61 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NDUFAF3Q9BU61 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NDUFAF3Q9BU61 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NDUFAF3Q9BU61 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NDUFAF3Q9BU61 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NDUFAF3Q9BU61 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NDUFAF3Q9BU61 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NDUFAF3Q9BU61 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NDUFAF3Q9BU61 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NDUFAF3Q9BU61 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NDUFAF3Q9BU61 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NDUFAF3Q9BU61 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NDUFAF3Q9BU61 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NDUFAF3Q9BU61 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NDUFAF3Q9BU61 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NDUFAF3Q9BU61 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NDUFAF3Q9BU61 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NDUFAF3Q9BU61 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NDUFAF3Q9BU61 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NDUFAF3Q9BU61 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NDUFAF3Q9BU61 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDUFAF3Q9BU61 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDUFAF3Q9BU61 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDUFAF3Q9BU61 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDUFAF3Q9BU61 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDUFAF3Q9BU61 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDUFAF3Q9BU61 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDUFAF3Q9BU61 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDUFAF3Q9BU61 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDUFAF3Q9BU61 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDUFAF3Q9BU61 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NDUFAF3Q9BU61 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDUFAF3Q9BU61 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDUFAF3Q9BU61 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDUFAF3Q9BU61 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDUFAF3Q9BU61 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDUFAF3Q9BU61 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDUFAF3Q9BU61 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDUFAF3Q9BU61 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDUFAF3Q9BU61 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDUFAF3Q9BU61 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDUFAF3Q9BU61 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NDUFAF3Q9BU61 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NDUFAF3Q9BU61 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NDUFAF3Q9BU61 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NDUFAF3Q9BU61 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NDUFAF3Q9BU61 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NDUFAF3Q9BU61 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDUFAF3Q9BU61 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDUFAF3Q9BU61 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NDUFAF3Q9BU61 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDUFAF3Q9BU61 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDUFAF3Q9BU61 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDUFAF3Q9BU61 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDUFAF3Q9BU61 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDUFAF3Q9BU61 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDUFAF3Q9BU61 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDUFAF3Q9BU61 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDUFAF3Q9BU61 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NDUFAF3Q9BU61 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NDUFAF3Q9BU61 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NDUFAF3Q9BU61 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NDUFAF3Q9BU61 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDUFAF3Q9BU61 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDUFAF3Q9BU61 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDUFAF3Q9BU61 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDUFAF3Q9BU61 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDUFAF3Q9BU61 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDUFAF3Q9BU61 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDUFAF3Q9BU61 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDUFAF3Q9BU61 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDUFAF3Q9BU61 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDUFAF3Q9BU61 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFAF3Q9BU61 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFAF3Q9BU61 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFAF3Q9BU61 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFAF3Q9BU61 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFAF3Q9BU61 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFAF3Q9BU61 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFAF3Q9BU61 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFAF3Q9BU61 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFAF3Q9BU61 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFAF3Q9BU61 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFAF3Q9BU61 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFAF3Q9BU61 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFAF3Q9BU61 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFAF3Q9BU61 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFAF3Q9BU61 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFAF3Q9BU61 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFAF3Q9BU61 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFAF3Q9BU61 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFAF3Q9BU61 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFAF3Q9BU61 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFAF3Q9BU61 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFAF3Q9BU61 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFAF3Q9BU61 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms