Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDC1Q9BTX1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDC1Q9BTX1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDC1Q9BTX1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDC1Q9BTX1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDC1Q9BTX1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDC1Q9BTX1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDC1Q9BTX1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDC1Q9BTX1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDC1Q9BTX1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDC1Q9BTX1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDC1Q9BTX1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDC1Q9BTX1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDC1Q9BTX1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDC1Q9BTX1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NDC1Q9BTX1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDC1Q9BTX1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDC1Q9BTX1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDC1Q9BTX1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDC1Q9BTX1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDC1Q9BTX1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDC1Q9BTX1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDC1Q9BTX1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDC1Q9BTX1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDC1Q9BTX1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NDC1Q9BTX1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NDC1Q9BTX1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDC1Q9BTX1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDC1Q9BTX1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDC1Q9BTX1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDC1Q9BTX1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NDC1Q9BTX1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDC1Q9BTX1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDC1Q9BTX1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDC1Q9BTX1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDC1Q9BTX1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDC1Q9BTX1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDC1Q9BTX1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDC1Q9BTX1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDC1Q9BTX1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDC1Q9BTX1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDC1Q9BTX1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDC1Q9BTX1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDC1Q9BTX1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NDC1Q9BTX1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDC1Q9BTX1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDC1Q9BTX1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDC1Q9BTX1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDC1Q9BTX1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDC1Q9BTX1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDC1Q9BTX1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDC1Q9BTX1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDC1Q9BTX1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NDC1Q9BTX1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDC1Q9BTX1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDC1Q9BTX1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDC1Q9BTX1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDC1Q9BTX1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDC1Q9BTX1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NDC1Q9BTX1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDC1Q9BTX1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDC1Q9BTX1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDC1Q9BTX1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NDC1Q9BTX1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDC1Q9BTX1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDC1Q9BTX1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDC1Q9BTX1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDC1Q9BTX1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDC1Q9BTX1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDC1Q9BTX1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDC1Q9BTX1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDC1Q9BTX1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NDC1Q9BTX1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NDC1Q9BTX1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NDC1Q9BTX1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms