Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2AFJQ9BTM1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2AFJQ9BTM1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
H2AFJQ9BTM1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2AFJQ9BTM1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2AFJQ9BTM1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2AFJQ9BTM1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2AFJQ9BTM1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2AFJQ9BTM1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2AFJQ9BTM1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2AFJQ9BTM1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2AFJQ9BTM1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2AFJQ9BTM1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2AFJQ9BTM1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2AFJQ9BTM1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2AFJQ9BTM1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2AFJQ9BTM1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
H2AFJQ9BTM1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2AFJQ9BTM1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2AFJQ9BTM1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2AFJQ9BTM1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2AFJQ9BTM1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2AFJQ9BTM1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2AFJQ9BTM1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2AFJQ9BTM1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2AFJQ9BTM1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
H2AFJQ9BTM1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2AFJQ9BTM1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2AFJQ9BTM1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2AFJQ9BTM1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2AFJQ9BTM1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2AFJQ9BTM1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2AFJQ9BTM1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2AFJQ9BTM1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2AFJQ9BTM1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2AFJQ9BTM1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2AFJQ9BTM1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2AFJQ9BTM1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2AFJQ9BTM1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
H2AFJQ9BTM1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H2AFJQ9BTM1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
H2AFJQ9BTM1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
H2AFJQ9BTM1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
H2AFJQ9BTM1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H2AFJQ9BTM1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2AFJQ9BTM1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2AFJQ9BTM1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
H2AFJQ9BTM1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H2AFJQ9BTM1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H2AFJQ9BTM1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H2AFJQ9BTM1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H2AFJQ9BTM1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
H2AFJQ9BTM1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2AFJQ9BTM1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2AFJQ9BTM1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2AFJQ9BTM1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2AFJQ9BTM1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2AFJQ9BTM1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2AFJQ9BTM1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
H2AFJQ9BTM1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
H2AFJQ9BTM1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H2AFJQ9BTM1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H2AFJQ9BTM1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2AFJQ9BTM1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
H2AFJQ9BTM1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2AFJQ9BTM1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2AFJQ9BTM1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2AFJQ9BTM1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
H2AFJQ9BTM1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
H2AFJQ9BTM1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H2AFJQ9BTM1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
H2AFJQ9BTM1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
H2AFJQ9BTM1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H2AFJQ9BTM1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
H2AFJQ9BTM1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2AFJQ9BTM1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2AFJQ9BTM1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2AFJQ9BTM1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2AFJQ9BTM1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2AFJQ9BTM1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2AFJQ9BTM1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2AFJQ9BTM1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2AFJQ9BTM1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2AFJQ9BTM1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2AFJQ9BTM1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2AFJQ9BTM1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2AFJQ9BTM1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2AFJQ9BTM1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2AFJQ9BTM1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2AFJQ9BTM1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2AFJQ9BTM1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2AFJQ9BTM1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2AFJQ9BTM1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2AFJQ9BTM1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2AFJQ9BTM1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2AFJQ9BTM1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2AFJQ9BTM1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2AFJQ9BTM1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2AFJQ9BTM1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2AFJQ9BTM1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms