Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPS4Q9BT78 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPS4Q9BT78 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPS4Q9BT78 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPS4Q9BT78 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPS4Q9BT78 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
COPS4Q9BT78 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
COPS4Q9BT78 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPS4Q9BT78 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPS4Q9BT78 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPS4Q9BT78 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COPS4Q9BT78 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPS4Q9BT78 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPS4Q9BT78 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPS4Q9BT78 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPS4Q9BT78 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPS4Q9BT78 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPS4Q9BT78 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPS4Q9BT78 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPS4Q9BT78 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPS4Q9BT78 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPS4Q9BT78 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPS4Q9BT78 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPS4Q9BT78 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPS4Q9BT78 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COPS4Q9BT78 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPS4Q9BT78 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPS4Q9BT78 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPS4Q9BT78 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPS4Q9BT78 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPS4Q9BT78 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPS4Q9BT78 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COPS4Q9BT78 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPS4Q9BT78 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
COPS4Q9BT78 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPS4Q9BT78 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPS4Q9BT78 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPS4Q9BT78 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
COPS4Q9BT78 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPS4Q9BT78 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPS4Q9BT78 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPS4Q9BT78 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPS4Q9BT78 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPS4Q9BT78 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPS4Q9BT78 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPS4Q9BT78 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COPS4Q9BT78 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPS4Q9BT78 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPS4Q9BT78 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPS4Q9BT78 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPS4Q9BT78 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPS4Q9BT78 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPS4Q9BT78 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPS4Q9BT78 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPS4Q9BT78 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPS4Q9BT78 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPS4Q9BT78 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPS4Q9BT78 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPS4Q9BT78 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPS4Q9BT78 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPS4Q9BT78 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPS4Q9BT78 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPS4Q9BT78 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COPS4Q9BT78 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPS4Q9BT78 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPS4Q9BT78 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPS4Q9BT78 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COPS4Q9BT78 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPS4Q9BT78 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPS4Q9BT78 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPS4Q9BT78 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPS4Q9BT78 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COPS4Q9BT78 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPS4Q9BT78 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPS4Q9BT78 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS4Q9BT78 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS4Q9BT78 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS4Q9BT78 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS4Q9BT78 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS4Q9BT78 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS4Q9BT78 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS4Q9BT78 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS4Q9BT78 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS4Q9BT78 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS4Q9BT78 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS4Q9BT78 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPS4Q9BT78 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPS4Q9BT78 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPS4Q9BT78 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPS4Q9BT78 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
COPS4Q9BT78 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPS4Q9BT78 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COPS4Q9BT78 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS4Q9BT78 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS4Q9BT78 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS4Q9BT78 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS4Q9BT78 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS4Q9BT78 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS4Q9BT78 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPS4Q9BT78 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms