Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT09

CNPY3, Protein canopy homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY3Q9BT09 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNPY3Q9BT09 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNPY3Q9BT09 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNPY3Q9BT09 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNPY3Q9BT09 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNPY3Q9BT09 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNPY3Q9BT09 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNPY3Q9BT09 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNPY3Q9BT09 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNPY3Q9BT09 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNPY3Q9BT09 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNPY3Q9BT09 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNPY3Q9BT09 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNPY3Q9BT09 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNPY3Q9BT09 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CNPY3Q9BT09 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNPY3Q9BT09 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNPY3Q9BT09 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNPY3Q9BT09 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNPY3Q9BT09 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNPY3Q9BT09 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNPY3Q9BT09 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNPY3Q9BT09 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNPY3Q9BT09 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNPY3Q9BT09 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNPY3Q9BT09 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNPY3Q9BT09 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNPY3Q9BT09 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNPY3Q9BT09 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNPY3Q9BT09 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNPY3Q9BT09 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNPY3Q9BT09 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CNPY3Q9BT09 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNPY3Q9BT09 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNPY3Q9BT09 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CNPY3Q9BT09 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNPY3Q9BT09 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNPY3Q9BT09 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNPY3Q9BT09 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNPY3Q9BT09 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNPY3Q9BT09 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNPY3Q9BT09 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNPY3Q9BT09 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNPY3Q9BT09 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNPY3Q9BT09 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNPY3Q9BT09 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNPY3Q9BT09 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNPY3Q9BT09 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNPY3Q9BT09 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CNPY3Q9BT09 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNPY3Q9BT09 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNPY3Q9BT09 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNPY3Q9BT09 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNPY3Q9BT09 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNPY3Q9BT09 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CNPY3Q9BT09 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNPY3Q9BT09 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNPY3Q9BT09 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNPY3Q9BT09 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNPY3Q9BT09 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNPY3Q9BT09 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNPY3Q9BT09 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNPY3Q9BT09 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNPY3Q9BT09 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNPY3Q9BT09 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNPY3Q9BT09 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNPY3Q9BT09 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNPY3Q9BT09 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNPY3Q9BT09 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNPY3Q9BT09 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNPY3Q9BT09 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNPY3Q9BT09 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNPY3Q9BT09 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNPY3Q9BT09 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNPY3Q9BT09 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNPY3Q9BT09 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNPY3Q9BT09 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNPY3Q9BT09 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNPY3Q9BT09 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNPY3Q9BT09 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNPY3Q9BT09 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNPY3Q9BT09 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNPY3Q9BT09 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNPY3Q9BT09 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNPY3Q9BT09 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNPY3Q9BT09 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CNPY3Q9BT09 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNPY3Q9BT09 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNPY3Q9BT09 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNPY3Q9BT09 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNPY3Q9BT09 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNPY3Q9BT09 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNPY3Q9BT09 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNPY3Q9BT09 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNPY3Q9BT09 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNPY3Q9BT09 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNPY3Q9BT09 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNPY3Q9BT09 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNPY3Q9BT09 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNPY3Q9BT09 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.7 ms