Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM79Q9BSE2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM79Q9BSE2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM79Q9BSE2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM79Q9BSE2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM79Q9BSE2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM79Q9BSE2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM79Q9BSE2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM79Q9BSE2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM79Q9BSE2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM79Q9BSE2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM79Q9BSE2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM79Q9BSE2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM79Q9BSE2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM79Q9BSE2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM79Q9BSE2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM79Q9BSE2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM79Q9BSE2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM79Q9BSE2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM79Q9BSE2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM79Q9BSE2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM79Q9BSE2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM79Q9BSE2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM79Q9BSE2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM79Q9BSE2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM79Q9BSE2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM79Q9BSE2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM79Q9BSE2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM79Q9BSE2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM79Q9BSE2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM79Q9BSE2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM79Q9BSE2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM79Q9BSE2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM79Q9BSE2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM79Q9BSE2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM79Q9BSE2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM79Q9BSE2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM79Q9BSE2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM79Q9BSE2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM79Q9BSE2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM79Q9BSE2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM79Q9BSE2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM79Q9BSE2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM79Q9BSE2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM79Q9BSE2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM79Q9BSE2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM79Q9BSE2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM79Q9BSE2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM79Q9BSE2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM79Q9BSE2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM79Q9BSE2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM79Q9BSE2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM79Q9BSE2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM79Q9BSE2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM79Q9BSE2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM79Q9BSE2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM79Q9BSE2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms