Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM7Q9BQ49 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMIM7Q9BQ49 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMIM7Q9BQ49 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMIM7Q9BQ49 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMIM7Q9BQ49 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMIM7Q9BQ49 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMIM7Q9BQ49 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMIM7Q9BQ49 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMIM7Q9BQ49 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM7Q9BQ49 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM7Q9BQ49 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM7Q9BQ49 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM7Q9BQ49 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM7Q9BQ49 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM7Q9BQ49 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM7Q9BQ49 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM7Q9BQ49 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM7Q9BQ49 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM7Q9BQ49 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM7Q9BQ49 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM7Q9BQ49 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM7Q9BQ49 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM7Q9BQ49 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM7Q9BQ49 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM7Q9BQ49 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM7Q9BQ49 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM7Q9BQ49 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM7Q9BQ49 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM7Q9BQ49 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM7Q9BQ49 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM7Q9BQ49 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM7Q9BQ49 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM7Q9BQ49 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM7Q9BQ49 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM7Q9BQ49 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM7Q9BQ49 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM7Q9BQ49 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM7Q9BQ49 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM7Q9BQ49 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1741.6 ms