Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF18Q99633 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF18Q99633 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF18Q99633 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF18Q99633 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF18Q99633 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF18Q99633 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF18Q99633 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF18Q99633 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF18Q99633 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF18Q99633 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF18Q99633 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF18Q99633 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF18Q99633 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF18Q99633 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF18Q99633 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF18Q99633 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF18Q99633 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF18Q99633 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF18Q99633 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF18Q99633 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF18Q99633 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF18Q99633 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF18Q99633 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF18Q99633 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF18Q99633 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF18Q99633 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRPF18Q99633 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRPF18Q99633 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRPF18Q99633 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF18Q99633 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF18Q99633 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF18Q99633 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF18Q99633 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF18Q99633 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF18Q99633 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF18Q99633 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF18Q99633 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF18Q99633 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF18Q99633 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF18Q99633 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF18Q99633 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF18Q99633 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF18Q99633 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF18Q99633 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF18Q99633 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF18Q99633 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF18Q99633 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF18Q99633 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF18Q99633 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF18Q99633 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF18Q99633 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF18Q99633 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF18Q99633 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF18Q99633 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF18Q99633 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF18Q99633 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF18Q99633 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF18Q99633 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF18Q99633 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF18Q99633 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF18Q99633 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF18Q99633 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF18Q99633 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF18Q99633 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF18Q99633 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF18Q99633 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF18Q99633 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF18Q99633 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF18Q99633 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF18Q99633 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF18Q99633 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF18Q99633 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF18Q99633 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF18Q99633 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF18Q99633 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF18Q99633 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF18Q99633 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF18Q99633 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF18Q99633 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF18Q99633 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF18Q99633 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF18Q99633 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF18Q99633 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF18Q99633 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF18Q99633 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF18Q99633 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF18Q99633 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF18Q99633 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF18Q99633 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF18Q99633 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF18Q99633 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF18Q99633 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF18Q99633 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF18Q99633 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF18Q99633 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF18Q99633 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF18Q99633 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF18Q99633 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF18Q99633 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms