Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POP1Q99575 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POP1Q99575 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POP1Q99575 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POP1Q99575 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
POP1Q99575 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POP1Q99575 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POP1Q99575 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POP1Q99575 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POP1Q99575 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POP1Q99575 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POP1Q99575 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POP1Q99575 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POP1Q99575 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POP1Q99575 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POP1Q99575 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POP1Q99575 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POP1Q99575 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POP1Q99575 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POP1Q99575 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POP1Q99575 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POP1Q99575 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POP1Q99575 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
POP1Q99575 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POP1Q99575 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
POP1Q99575 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POP1Q99575 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POP1Q99575 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POP1Q99575 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POP1Q99575 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POP1Q99575 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POP1Q99575 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POP1Q99575 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POP1Q99575 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POP1Q99575 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POP1Q99575 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POP1Q99575 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POP1Q99575 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POP1Q99575 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POP1Q99575 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POP1Q99575 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POP1Q99575 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POP1Q99575 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POP1Q99575 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POP1Q99575 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
POP1Q99575 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POP1Q99575 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
POP1Q99575 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
POP1Q99575 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
POP1Q99575 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
POP1Q99575 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POP1Q99575 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
POP1Q99575 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POP1Q99575 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
POP1Q99575 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POP1Q99575 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
POP1Q99575 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POP1Q99575 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POP1Q99575 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POP1Q99575 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POP1Q99575 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POP1Q99575 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POP1Q99575 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POP1Q99575 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POP1Q99575 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POP1Q99575 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POP1Q99575 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POP1Q99575 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POP1Q99575 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POP1Q99575 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POP1Q99575 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
POP1Q99575 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POP1Q99575 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POP1Q99575 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POP1Q99575 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POP1Q99575 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POP1Q99575 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POP1Q99575 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POP1Q99575 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POP1Q99575 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
POP1Q99575 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POP1Q99575 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POP1Q99575 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POP1Q99575 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POP1Q99575 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POP1Q99575 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
POP1Q99575 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POP1Q99575 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POP1Q99575 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POP1Q99575 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POP1Q99575 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POP1Q99575 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POP1Q99575 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POP1Q99575 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POP1Q99575 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POP1Q99575 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POP1Q99575 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POP1Q99575 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POP1Q99575 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
POP1Q99575 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms