Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MMP19Q99542 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MMP19Q99542 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MMP19Q99542 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MMP19Q99542 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MMP19Q99542 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MMP19Q99542 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MMP19Q99542 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MMP19Q99542 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MMP19Q99542 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MMP19Q99542 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MMP19Q99542 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MMP19Q99542 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
MMP19Q99542 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MMP19Q99542 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MMP19Q99542 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MMP19Q99542 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MMP19Q99542 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MMP19Q99542 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MMP19Q99542 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MMP19Q99542 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MMP19Q99542 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MMP19Q99542 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MMP19Q99542 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MMP19Q99542 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MMP19Q99542 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MMP19Q99542 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MMP19Q99542 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MMP19Q99542 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MMP19Q99542 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MMP19Q99542 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MMP19Q99542 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MMP19Q99542 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MMP19Q99542 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MMP19Q99542 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MMP19Q99542 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MMP19Q99542 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MMP19Q99542 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MMP19Q99542 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MMP19Q99542 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MMP19Q99542 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
MMP19Q99542 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MMP19Q99542 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MMP19Q99542 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MMP19Q99542 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MMP19Q99542 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MMP19Q99542 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MMP19Q99542 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MMP19Q99542 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MMP19Q99542 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MMP19Q99542 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MMP19Q99542 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MMP19Q99542 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MMP19Q99542 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MMP19Q99542 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MMP19Q99542 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MMP19Q99542 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MMP19Q99542 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MMP19Q99542 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MMP19Q99542 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MMP19Q99542 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MMP19Q99542 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MMP19Q99542 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MMP19Q99542 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MMP19Q99542 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MMP19Q99542 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MMP19Q99542 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MMP19Q99542 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MMP19Q99542 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MMP19Q99542 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MMP19Q99542 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MMP19Q99542 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MMP19Q99542 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
MMP19Q99542 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MMP19Q99542 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MMP19Q99542 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MMP19Q99542 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MMP19Q99542 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MMP19Q99542 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MMP19Q99542 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MMP19Q99542 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MMP19Q99542 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MMP19Q99542 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MMP19Q99542 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MMP19Q99542 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MMP19Q99542 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MMP19Q99542 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MMP19Q99542 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MMP19Q99542 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MMP19Q99542 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MMP19Q99542 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MMP19Q99542 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MMP19Q99542 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MMP19Q99542 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MMP19Q99542 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MMP19Q99542 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MMP19Q99542 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MMP19Q99542 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MMP19Q99542 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
MMP19Q99542 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms