Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPS6KC1Q96S38 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPS6KC1Q96S38 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPS6KC1Q96S38 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPS6KC1Q96S38 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPS6KC1Q96S38 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPS6KC1Q96S38 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPS6KC1Q96S38 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RPS6KC1Q96S38 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPS6KC1Q96S38 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPS6KC1Q96S38 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPS6KC1Q96S38 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPS6KC1Q96S38 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPS6KC1Q96S38 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPS6KC1Q96S38 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPS6KC1Q96S38 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPS6KC1Q96S38 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPS6KC1Q96S38 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPS6KC1Q96S38 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPS6KC1Q96S38 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RPS6KC1Q96S38 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RPS6KC1Q96S38 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RPS6KC1Q96S38 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPS6KC1Q96S38 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPS6KC1Q96S38 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPS6KC1Q96S38 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPS6KC1Q96S38 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPS6KC1Q96S38 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPS6KC1Q96S38 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPS6KC1Q96S38 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPS6KC1Q96S38 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPS6KC1Q96S38 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPS6KC1Q96S38 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPS6KC1Q96S38 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPS6KC1Q96S38 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPS6KC1Q96S38 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPS6KC1Q96S38 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPS6KC1Q96S38 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPS6KC1Q96S38 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPS6KC1Q96S38 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPS6KC1Q96S38 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPS6KC1Q96S38 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPS6KC1Q96S38 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPS6KC1Q96S38 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RPS6KC1Q96S38 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPS6KC1Q96S38 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPS6KC1Q96S38 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RPS6KC1Q96S38 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RPS6KC1Q96S38 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPS6KC1Q96S38 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPS6KC1Q96S38 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPS6KC1Q96S38 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RPS6KC1Q96S38 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPS6KC1Q96S38 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPS6KC1Q96S38 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPS6KC1Q96S38 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RPS6KC1Q96S38 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPS6KC1Q96S38 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPS6KC1Q96S38 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPS6KC1Q96S38 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPS6KC1Q96S38 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPS6KC1Q96S38 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPS6KC1Q96S38 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPS6KC1Q96S38 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPS6KC1Q96S38 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPS6KC1Q96S38 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPS6KC1Q96S38 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPS6KC1Q96S38 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPS6KC1Q96S38 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPS6KC1Q96S38 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPS6KC1Q96S38 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPS6KC1Q96S38 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPS6KC1Q96S38 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPS6KC1Q96S38 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPS6KC1Q96S38 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPS6KC1Q96S38 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RPS6KC1Q96S38 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPS6KC1Q96S38 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPS6KC1Q96S38 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RPS6KC1Q96S38 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPS6KC1Q96S38 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPS6KC1Q96S38 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPS6KC1Q96S38 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPS6KC1Q96S38 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPS6KC1Q96S38 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPS6KC1Q96S38 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPS6KC1Q96S38 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPS6KC1Q96S38 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPS6KC1Q96S38 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPS6KC1Q96S38 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPS6KC1Q96S38 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPS6KC1Q96S38 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPS6KC1Q96S38 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPS6KC1Q96S38 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPS6KC1Q96S38 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPS6KC1Q96S38 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPS6KC1Q96S38 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPS6KC1Q96S38 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RPS6KC1Q96S38 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPS6KC1Q96S38 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms