Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.42■■■■■ 4.38
IFT140Q96RY7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
IFT140Q96RY7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
IFT140Q96RY7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
IFT140Q96RY7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
IFT140Q96RY7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
IFT140Q96RY7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.38
IFT140Q96RY7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
IFT140Q96RY7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC42.38■■■■■ 4.38
IFT140Q96RY7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.37
IFT140Q96RY7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC42.37■■■■■ 4.37
IFT140Q96RY7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
IFT140Q96RY7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC42.36■■■■■ 4.37
IFT140Q96RY7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
IFT140Q96RY7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
IFT140Q96RY7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
IFT140Q96RY7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
IFT140Q96RY7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
IFT140Q96RY7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
IFT140Q96RY7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC42.32■■■■■ 4.37
IFT140Q96RY7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC42.32■■■■■ 4.37
IFT140Q96RY7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.36
IFT140Q96RY7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
IFT140Q96RY7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
IFT140Q96RY7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
IFT140Q96RY7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
IFT140Q96RY7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
IFT140Q96RY7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
IFT140Q96RY7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
IFT140Q96RY7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
IFT140Q96RY7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
IFT140Q96RY7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
IFT140Q96RY7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
IFT140Q96RY7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
IFT140Q96RY7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
IFT140Q96RY7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC42.25■■■■■ 4.35
IFT140Q96RY7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC42.25■■■■■ 4.35
IFT140Q96RY7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC42.25■■■■■ 4.35
IFT140Q96RY7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
IFT140Q96RY7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
IFT140Q96RY7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
IFT140Q96RY7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC42.23■■■■■ 4.35
IFT140Q96RY7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
IFT140Q96RY7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
IFT140Q96RY7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC42.22■■■■■ 4.35
IFT140Q96RY7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC42.22■■■■■ 4.35
IFT140Q96RY7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
IFT140Q96RY7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
IFT140Q96RY7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
IFT140Q96RY7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
IFT140Q96RY7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC42.2■■■■■ 4.35
IFT140Q96RY7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
IFT140Q96RY7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.35
IFT140Q96RY7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC42.19■■■■■ 4.34
IFT140Q96RY7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
IFT140Q96RY7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
IFT140Q96RY7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC42.18■■■■■ 4.34
IFT140Q96RY7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC42.18■■■■■ 4.34
IFT140Q96RY7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
IFT140Q96RY7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
IFT140Q96RY7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
IFT140Q96RY7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
IFT140Q96RY7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
IFT140Q96RY7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
IFT140Q96RY7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
IFT140Q96RY7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
IFT140Q96RY7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
IFT140Q96RY7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
IFT140Q96RY7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC42.14■■■■■ 4.34
IFT140Q96RY7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
IFT140Q96RY7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
IFT140Q96RY7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
IFT140Q96RY7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC42.11■■■■■ 4.33
IFT140Q96RY7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
IFT140Q96RY7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
IFT140Q96RY7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
IFT140Q96RY7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
IFT140Q96RY7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
IFT140Q96RY7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
IFT140Q96RY7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC42.08■■■■■ 4.33
IFT140Q96RY7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
IFT140Q96RY7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.33
IFT140Q96RY7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.32
IFT140Q96RY7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
IFT140Q96RY7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
IFT140Q96RY7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
IFT140Q96RY7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
IFT140Q96RY7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
IFT140Q96RY7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
IFT140Q96RY7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
IFT140Q96RY7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
IFT140Q96RY7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
IFT140Q96RY7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
IFT140Q96RY7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
IFT140Q96RY7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
IFT140Q96RY7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
IFT140Q96RY7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC41.97■■■■■ 4.31
IFT140Q96RY7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
IFT140Q96RY7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC41.97■■■■■ 4.31
IFT140Q96RY7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms