Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUDCD1Q96RS6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUDCD1Q96RS6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUDCD1Q96RS6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUDCD1Q96RS6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUDCD1Q96RS6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUDCD1Q96RS6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDCD1Q96RS6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDCD1Q96RS6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDCD1Q96RS6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDCD1Q96RS6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDCD1Q96RS6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDCD1Q96RS6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDCD1Q96RS6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDCD1Q96RS6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDCD1Q96RS6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDCD1Q96RS6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDCD1Q96RS6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUDCD1Q96RS6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NUDCD1Q96RS6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUDCD1Q96RS6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUDCD1Q96RS6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUDCD1Q96RS6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUDCD1Q96RS6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUDCD1Q96RS6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUDCD1Q96RS6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUDCD1Q96RS6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUDCD1Q96RS6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUDCD1Q96RS6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUDCD1Q96RS6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUDCD1Q96RS6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUDCD1Q96RS6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUDCD1Q96RS6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUDCD1Q96RS6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUDCD1Q96RS6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUDCD1Q96RS6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUDCD1Q96RS6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUDCD1Q96RS6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUDCD1Q96RS6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUDCD1Q96RS6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUDCD1Q96RS6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUDCD1Q96RS6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUDCD1Q96RS6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUDCD1Q96RS6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUDCD1Q96RS6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUDCD1Q96RS6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUDCD1Q96RS6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUDCD1Q96RS6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUDCD1Q96RS6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUDCD1Q96RS6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUDCD1Q96RS6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUDCD1Q96RS6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUDCD1Q96RS6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUDCD1Q96RS6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUDCD1Q96RS6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUDCD1Q96RS6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUDCD1Q96RS6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUDCD1Q96RS6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUDCD1Q96RS6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUDCD1Q96RS6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUDCD1Q96RS6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUDCD1Q96RS6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUDCD1Q96RS6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUDCD1Q96RS6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUDCD1Q96RS6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUDCD1Q96RS6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUDCD1Q96RS6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUDCD1Q96RS6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUDCD1Q96RS6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUDCD1Q96RS6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUDCD1Q96RS6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUDCD1Q96RS6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUDCD1Q96RS6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUDCD1Q96RS6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUDCD1Q96RS6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUDCD1Q96RS6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUDCD1Q96RS6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUDCD1Q96RS6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUDCD1Q96RS6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUDCD1Q96RS6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUDCD1Q96RS6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUDCD1Q96RS6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUDCD1Q96RS6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUDCD1Q96RS6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUDCD1Q96RS6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUDCD1Q96RS6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUDCD1Q96RS6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUDCD1Q96RS6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUDCD1Q96RS6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUDCD1Q96RS6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUDCD1Q96RS6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUDCD1Q96RS6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUDCD1Q96RS6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUDCD1Q96RS6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUDCD1Q96RS6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUDCD1Q96RS6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUDCD1Q96RS6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUDCD1Q96RS6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUDCD1Q96RS6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUDCD1Q96RS6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms