Protein–RNA interactions for Protein: Q96RP7

GAL3ST4, Galactose-3-O-sulfotransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST4Q96RP7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GAL3ST4Q96RP7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAL3ST4Q96RP7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GAL3ST4Q96RP7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAL3ST4Q96RP7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAL3ST4Q96RP7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAL3ST4Q96RP7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAL3ST4Q96RP7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GAL3ST4Q96RP7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GAL3ST4Q96RP7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GAL3ST4Q96RP7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GAL3ST4Q96RP7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GAL3ST4Q96RP7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GAL3ST4Q96RP7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GAL3ST4Q96RP7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GAL3ST4Q96RP7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GAL3ST4Q96RP7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GAL3ST4Q96RP7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GAL3ST4Q96RP7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GAL3ST4Q96RP7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GAL3ST4Q96RP7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GAL3ST4Q96RP7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GAL3ST4Q96RP7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GAL3ST4Q96RP7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GAL3ST4Q96RP7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GAL3ST4Q96RP7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GAL3ST4Q96RP7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GAL3ST4Q96RP7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GAL3ST4Q96RP7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GAL3ST4Q96RP7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GAL3ST4Q96RP7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GAL3ST4Q96RP7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GAL3ST4Q96RP7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GAL3ST4Q96RP7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GAL3ST4Q96RP7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAL3ST4Q96RP7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GAL3ST4Q96RP7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAL3ST4Q96RP7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAL3ST4Q96RP7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAL3ST4Q96RP7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAL3ST4Q96RP7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GAL3ST4Q96RP7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GAL3ST4Q96RP7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GAL3ST4Q96RP7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GAL3ST4Q96RP7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GAL3ST4Q96RP7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GAL3ST4Q96RP7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GAL3ST4Q96RP7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GAL3ST4Q96RP7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GAL3ST4Q96RP7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GAL3ST4Q96RP7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GAL3ST4Q96RP7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GAL3ST4Q96RP7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GAL3ST4Q96RP7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GAL3ST4Q96RP7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GAL3ST4Q96RP7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GAL3ST4Q96RP7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GAL3ST4Q96RP7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GAL3ST4Q96RP7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GAL3ST4Q96RP7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GAL3ST4Q96RP7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GAL3ST4Q96RP7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GAL3ST4Q96RP7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GAL3ST4Q96RP7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GAL3ST4Q96RP7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GAL3ST4Q96RP7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GAL3ST4Q96RP7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GAL3ST4Q96RP7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GAL3ST4Q96RP7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GAL3ST4Q96RP7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GAL3ST4Q96RP7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GAL3ST4Q96RP7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GAL3ST4Q96RP7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GAL3ST4Q96RP7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GAL3ST4Q96RP7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GAL3ST4Q96RP7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GAL3ST4Q96RP7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GAL3ST4Q96RP7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
GAL3ST4Q96RP7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GAL3ST4Q96RP7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GAL3ST4Q96RP7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GAL3ST4Q96RP7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GAL3ST4Q96RP7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GAL3ST4Q96RP7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GAL3ST4Q96RP7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GAL3ST4Q96RP7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GAL3ST4Q96RP7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GAL3ST4Q96RP7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GAL3ST4Q96RP7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GAL3ST4Q96RP7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GAL3ST4Q96RP7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GAL3ST4Q96RP7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GAL3ST4Q96RP7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GAL3ST4Q96RP7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GAL3ST4Q96RP7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GAL3ST4Q96RP7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GAL3ST4Q96RP7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GAL3ST4Q96RP7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GAL3ST4Q96RP7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GAL3ST4Q96RP7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms