Protein–RNA interactions for Protein: Q96QH2

PRAM1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAM1Q96QH2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PRAM1Q96QH2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PRAM1Q96QH2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PRAM1Q96QH2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PRAM1Q96QH2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PRAM1Q96QH2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PRAM1Q96QH2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PRAM1Q96QH2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
PRAM1Q96QH2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PRAM1Q96QH2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PRAM1Q96QH2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PRAM1Q96QH2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PRAM1Q96QH2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PRAM1Q96QH2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PRAM1Q96QH2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
PRAM1Q96QH2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PRAM1Q96QH2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PRAM1Q96QH2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PRAM1Q96QH2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PRAM1Q96QH2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PRAM1Q96QH2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PRAM1Q96QH2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PRAM1Q96QH2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PRAM1Q96QH2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PRAM1Q96QH2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PRAM1Q96QH2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PRAM1Q96QH2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PRAM1Q96QH2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
PRAM1Q96QH2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PRAM1Q96QH2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PRAM1Q96QH2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PRAM1Q96QH2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PRAM1Q96QH2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PRAM1Q96QH2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
PRAM1Q96QH2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PRAM1Q96QH2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PRAM1Q96QH2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PRAM1Q96QH2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PRAM1Q96QH2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PRAM1Q96QH2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PRAM1Q96QH2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PRAM1Q96QH2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
PRAM1Q96QH2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PRAM1Q96QH2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PRAM1Q96QH2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PRAM1Q96QH2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
PRAM1Q96QH2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PRAM1Q96QH2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PRAM1Q96QH2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
PRAM1Q96QH2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PRAM1Q96QH2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PRAM1Q96QH2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PRAM1Q96QH2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PRAM1Q96QH2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PRAM1Q96QH2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PRAM1Q96QH2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
PRAM1Q96QH2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PRAM1Q96QH2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PRAM1Q96QH2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PRAM1Q96QH2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PRAM1Q96QH2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PRAM1Q96QH2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PRAM1Q96QH2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
PRAM1Q96QH2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PRAM1Q96QH2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PRAM1Q96QH2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PRAM1Q96QH2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PRAM1Q96QH2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PRAM1Q96QH2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PRAM1Q96QH2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PRAM1Q96QH2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PRAM1Q96QH2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PRAM1Q96QH2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
PRAM1Q96QH2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
PRAM1Q96QH2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
PRAM1Q96QH2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PRAM1Q96QH2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PRAM1Q96QH2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PRAM1Q96QH2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PRAM1Q96QH2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PRAM1Q96QH2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PRAM1Q96QH2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PRAM1Q96QH2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PRAM1Q96QH2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
PRAM1Q96QH2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PRAM1Q96QH2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PRAM1Q96QH2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PRAM1Q96QH2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PRAM1Q96QH2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PRAM1Q96QH2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PRAM1Q96QH2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PRAM1Q96QH2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PRAM1Q96QH2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PRAM1Q96QH2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
PRAM1Q96QH2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
PRAM1Q96QH2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PRAM1Q96QH2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PRAM1Q96QH2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PRAM1Q96QH2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PRAM1Q96QH2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms