Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
LMTK3Q96Q04 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
LMTK3Q96Q04 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
LMTK3Q96Q04 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
LMTK3Q96Q04 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
LMTK3Q96Q04 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
LMTK3Q96Q04 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
LMTK3Q96Q04 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
LMTK3Q96Q04 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
LMTK3Q96Q04 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
LMTK3Q96Q04 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
LMTK3Q96Q04 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
LMTK3Q96Q04 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
LMTK3Q96Q04 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
LMTK3Q96Q04 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
LMTK3Q96Q04 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
LMTK3Q96Q04 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
LMTK3Q96Q04 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
LMTK3Q96Q04 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
LMTK3Q96Q04 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
LMTK3Q96Q04 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
LMTK3Q96Q04 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
LMTK3Q96Q04 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
LMTK3Q96Q04 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
LMTK3Q96Q04 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
LMTK3Q96Q04 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC36.71■■■■□ 3.47
LMTK3Q96Q04 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
LMTK3Q96Q04 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
LMTK3Q96Q04 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
LMTK3Q96Q04 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC36.7■■■■□ 3.47
LMTK3Q96Q04 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
LMTK3Q96Q04 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
LMTK3Q96Q04 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
LMTK3Q96Q04 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
LMTK3Q96Q04 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
LMTK3Q96Q04 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
LMTK3Q96Q04 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
LMTK3Q96Q04 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
LMTK3Q96Q04 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
LMTK3Q96Q04 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
LMTK3Q96Q04 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
LMTK3Q96Q04 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
LMTK3Q96Q04 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
LMTK3Q96Q04 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
LMTK3Q96Q04 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
LMTK3Q96Q04 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
LMTK3Q96Q04 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
LMTK3Q96Q04 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
LMTK3Q96Q04 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
LMTK3Q96Q04 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
LMTK3Q96Q04 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
LMTK3Q96Q04 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
LMTK3Q96Q04 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
LMTK3Q96Q04 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
LMTK3Q96Q04 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
LMTK3Q96Q04 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
LMTK3Q96Q04 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
LMTK3Q96Q04 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
LMTK3Q96Q04 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
LMTK3Q96Q04 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
LMTK3Q96Q04 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
LMTK3Q96Q04 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
LMTK3Q96Q04 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
LMTK3Q96Q04 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
LMTK3Q96Q04 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
LMTK3Q96Q04 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
LMTK3Q96Q04 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
LMTK3Q96Q04 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
LMTK3Q96Q04 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
LMTK3Q96Q04 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
LMTK3Q96Q04 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
LMTK3Q96Q04 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
LMTK3Q96Q04 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
LMTK3Q96Q04 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
LMTK3Q96Q04 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
LMTK3Q96Q04 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
LMTK3Q96Q04 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
LMTK3Q96Q04 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC36.55■■■■□ 3.44
LMTK3Q96Q04 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
LMTK3Q96Q04 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
LMTK3Q96Q04 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
LMTK3Q96Q04 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
LMTK3Q96Q04 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
LMTK3Q96Q04 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
LMTK3Q96Q04 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
LMTK3Q96Q04 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
LMTK3Q96Q04 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
LMTK3Q96Q04 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
LMTK3Q96Q04 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
LMTK3Q96Q04 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
LMTK3Q96Q04 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
LMTK3Q96Q04 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
LMTK3Q96Q04 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
LMTK3Q96Q04 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
LMTK3Q96Q04 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
LMTK3Q96Q04 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
LMTK3Q96Q04 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
LMTK3Q96Q04 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
LMTK3Q96Q04 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
LMTK3Q96Q04 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms