Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSPG4P5Q96PW8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSPG4P5Q96PW8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSPG4P5Q96PW8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSPG4P5Q96PW8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSPG4P5Q96PW8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSPG4P5Q96PW8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSPG4P5Q96PW8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSPG4P5Q96PW8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CSPG4P5Q96PW8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSPG4P5Q96PW8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSPG4P5Q96PW8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSPG4P5Q96PW8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSPG4P5Q96PW8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSPG4P5Q96PW8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSPG4P5Q96PW8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSPG4P5Q96PW8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSPG4P5Q96PW8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSPG4P5Q96PW8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSPG4P5Q96PW8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CSPG4P5Q96PW8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSPG4P5Q96PW8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSPG4P5Q96PW8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CSPG4P5Q96PW8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSPG4P5Q96PW8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSPG4P5Q96PW8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSPG4P5Q96PW8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSPG4P5Q96PW8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSPG4P5Q96PW8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSPG4P5Q96PW8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSPG4P5Q96PW8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSPG4P5Q96PW8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSPG4P5Q96PW8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSPG4P5Q96PW8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSPG4P5Q96PW8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSPG4P5Q96PW8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSPG4P5Q96PW8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSPG4P5Q96PW8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSPG4P5Q96PW8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSPG4P5Q96PW8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSPG4P5Q96PW8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSPG4P5Q96PW8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSPG4P5Q96PW8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CSPG4P5Q96PW8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSPG4P5Q96PW8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSPG4P5Q96PW8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSPG4P5Q96PW8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSPG4P5Q96PW8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSPG4P5Q96PW8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSPG4P5Q96PW8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSPG4P5Q96PW8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSPG4P5Q96PW8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSPG4P5Q96PW8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CSPG4P5Q96PW8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSPG4P5Q96PW8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSPG4P5Q96PW8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSPG4P5Q96PW8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSPG4P5Q96PW8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSPG4P5Q96PW8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSPG4P5Q96PW8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSPG4P5Q96PW8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSPG4P5Q96PW8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSPG4P5Q96PW8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSPG4P5Q96PW8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSPG4P5Q96PW8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSPG4P5Q96PW8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSPG4P5Q96PW8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSPG4P5Q96PW8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSPG4P5Q96PW8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSPG4P5Q96PW8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSPG4P5Q96PW8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSPG4P5Q96PW8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSPG4P5Q96PW8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSPG4P5Q96PW8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSPG4P5Q96PW8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSPG4P5Q96PW8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSPG4P5Q96PW8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSPG4P5Q96PW8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSPG4P5Q96PW8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSPG4P5Q96PW8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CSPG4P5Q96PW8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CSPG4P5Q96PW8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSPG4P5Q96PW8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSPG4P5Q96PW8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSPG4P5Q96PW8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSPG4P5Q96PW8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSPG4P5Q96PW8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSPG4P5Q96PW8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSPG4P5Q96PW8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSPG4P5Q96PW8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSPG4P5Q96PW8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSPG4P5Q96PW8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSPG4P5Q96PW8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSPG4P5Q96PW8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSPG4P5Q96PW8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSPG4P5Q96PW8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSPG4P5Q96PW8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSPG4P5Q96PW8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSPG4P5Q96PW8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSPG4P5Q96PW8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms