Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGAP3Q96P47 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGAP3Q96P47 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGAP3Q96P47 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGAP3Q96P47 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGAP3Q96P47 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGAP3Q96P47 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGAP3Q96P47 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGAP3Q96P47 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGAP3Q96P47 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGAP3Q96P47 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGAP3Q96P47 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGAP3Q96P47 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGAP3Q96P47 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGAP3Q96P47 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGAP3Q96P47 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGAP3Q96P47 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGAP3Q96P47 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGAP3Q96P47 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGAP3Q96P47 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGAP3Q96P47 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGAP3Q96P47 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGAP3Q96P47 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGAP3Q96P47 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGAP3Q96P47 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGAP3Q96P47 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGAP3Q96P47 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGAP3Q96P47 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGAP3Q96P47 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
AGAP3Q96P47 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGAP3Q96P47 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGAP3Q96P47 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
AGAP3Q96P47 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGAP3Q96P47 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGAP3Q96P47 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGAP3Q96P47 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGAP3Q96P47 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGAP3Q96P47 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGAP3Q96P47 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGAP3Q96P47 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGAP3Q96P47 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGAP3Q96P47 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGAP3Q96P47 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGAP3Q96P47 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGAP3Q96P47 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGAP3Q96P47 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGAP3Q96P47 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGAP3Q96P47 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGAP3Q96P47 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGAP3Q96P47 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGAP3Q96P47 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGAP3Q96P47 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGAP3Q96P47 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGAP3Q96P47 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGAP3Q96P47 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGAP3Q96P47 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGAP3Q96P47 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGAP3Q96P47 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGAP3Q96P47 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
AGAP3Q96P47 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGAP3Q96P47 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
AGAP3Q96P47 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AGAP3Q96P47 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AGAP3Q96P47 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AGAP3Q96P47 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AGAP3Q96P47 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGAP3Q96P47 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGAP3Q96P47 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGAP3Q96P47 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGAP3Q96P47 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGAP3Q96P47 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGAP3Q96P47 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGAP3Q96P47 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGAP3Q96P47 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGAP3Q96P47 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGAP3Q96P47 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGAP3Q96P47 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGAP3Q96P47 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
AGAP3Q96P47 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGAP3Q96P47 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AGAP3Q96P47 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AGAP3Q96P47 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AGAP3Q96P47 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AGAP3Q96P47 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AGAP3Q96P47 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AGAP3Q96P47 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AGAP3Q96P47 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGAP3Q96P47 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGAP3Q96P47 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
AGAP3Q96P47 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGAP3Q96P47 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGAP3Q96P47 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGAP3Q96P47 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGAP3Q96P47 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AGAP3Q96P47 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AGAP3Q96P47 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AGAP3Q96P47 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
AGAP3Q96P47 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGAP3Q96P47 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGAP3Q96P47 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms