Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB1

FOPNL, LisH domain-containing protein FOPNL, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOPNLQ96NB1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOPNLQ96NB1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOPNLQ96NB1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOPNLQ96NB1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOPNLQ96NB1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOPNLQ96NB1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOPNLQ96NB1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOPNLQ96NB1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOPNLQ96NB1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOPNLQ96NB1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOPNLQ96NB1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOPNLQ96NB1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOPNLQ96NB1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FOPNLQ96NB1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FOPNLQ96NB1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOPNLQ96NB1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOPNLQ96NB1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOPNLQ96NB1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOPNLQ96NB1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOPNLQ96NB1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOPNLQ96NB1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOPNLQ96NB1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOPNLQ96NB1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOPNLQ96NB1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FOPNLQ96NB1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
FOPNLQ96NB1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FOPNLQ96NB1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOPNLQ96NB1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOPNLQ96NB1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOPNLQ96NB1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOPNLQ96NB1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOPNLQ96NB1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOPNLQ96NB1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOPNLQ96NB1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOPNLQ96NB1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOPNLQ96NB1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOPNLQ96NB1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOPNLQ96NB1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOPNLQ96NB1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOPNLQ96NB1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOPNLQ96NB1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOPNLQ96NB1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOPNLQ96NB1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOPNLQ96NB1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOPNLQ96NB1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOPNLQ96NB1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOPNLQ96NB1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOPNLQ96NB1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOPNLQ96NB1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOPNLQ96NB1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOPNLQ96NB1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOPNLQ96NB1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOPNLQ96NB1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOPNLQ96NB1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOPNLQ96NB1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOPNLQ96NB1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOPNLQ96NB1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOPNLQ96NB1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOPNLQ96NB1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOPNLQ96NB1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOPNLQ96NB1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOPNLQ96NB1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOPNLQ96NB1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOPNLQ96NB1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOPNLQ96NB1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOPNLQ96NB1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FOPNLQ96NB1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOPNLQ96NB1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOPNLQ96NB1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOPNLQ96NB1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOPNLQ96NB1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOPNLQ96NB1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOPNLQ96NB1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOPNLQ96NB1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOPNLQ96NB1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOPNLQ96NB1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOPNLQ96NB1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOPNLQ96NB1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOPNLQ96NB1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOPNLQ96NB1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOPNLQ96NB1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOPNLQ96NB1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOPNLQ96NB1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FOPNLQ96NB1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FOPNLQ96NB1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOPNLQ96NB1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOPNLQ96NB1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOPNLQ96NB1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOPNLQ96NB1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOPNLQ96NB1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOPNLQ96NB1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOPNLQ96NB1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FOPNLQ96NB1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOPNLQ96NB1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOPNLQ96NB1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOPNLQ96NB1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOPNLQ96NB1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOPNLQ96NB1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOPNLQ96NB1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOPNLQ96NB1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms