Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
YTHDC1Q96MU7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
YTHDC1Q96MU7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
YTHDC1Q96MU7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
YTHDC1Q96MU7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
YTHDC1Q96MU7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
YTHDC1Q96MU7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
YTHDC1Q96MU7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
YTHDC1Q96MU7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
YTHDC1Q96MU7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
YTHDC1Q96MU7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
YTHDC1Q96MU7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
YTHDC1Q96MU7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
YTHDC1Q96MU7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
YTHDC1Q96MU7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
YTHDC1Q96MU7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
YTHDC1Q96MU7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
YTHDC1Q96MU7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
YTHDC1Q96MU7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
YTHDC1Q96MU7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
YTHDC1Q96MU7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
YTHDC1Q96MU7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
YTHDC1Q96MU7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
YTHDC1Q96MU7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
YTHDC1Q96MU7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
YTHDC1Q96MU7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
YTHDC1Q96MU7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
YTHDC1Q96MU7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
YTHDC1Q96MU7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
YTHDC1Q96MU7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
YTHDC1Q96MU7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
YTHDC1Q96MU7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
YTHDC1Q96MU7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
YTHDC1Q96MU7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
YTHDC1Q96MU7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
YTHDC1Q96MU7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
YTHDC1Q96MU7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
YTHDC1Q96MU7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
YTHDC1Q96MU7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
YTHDC1Q96MU7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
YTHDC1Q96MU7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
YTHDC1Q96MU7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
YTHDC1Q96MU7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
YTHDC1Q96MU7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
YTHDC1Q96MU7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
YTHDC1Q96MU7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
YTHDC1Q96MU7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
YTHDC1Q96MU7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
YTHDC1Q96MU7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
YTHDC1Q96MU7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
YTHDC1Q96MU7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
YTHDC1Q96MU7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
YTHDC1Q96MU7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
YTHDC1Q96MU7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
YTHDC1Q96MU7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
YTHDC1Q96MU7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
YTHDC1Q96MU7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
YTHDC1Q96MU7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
YTHDC1Q96MU7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
YTHDC1Q96MU7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
YTHDC1Q96MU7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC33.77■■■■□ 3
YTHDC1Q96MU7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
YTHDC1Q96MU7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
YTHDC1Q96MU7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
YTHDC1Q96MU7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.76■■■■□ 3
YTHDC1Q96MU7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
YTHDC1Q96MU7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
YTHDC1Q96MU7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
YTHDC1Q96MU7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
YTHDC1Q96MU7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
YTHDC1Q96MU7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
YTHDC1Q96MU7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
YTHDC1Q96MU7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
YTHDC1Q96MU7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
YTHDC1Q96MU7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
YTHDC1Q96MU7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.73■■■□□ 2.99
YTHDC1Q96MU7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
YTHDC1Q96MU7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
YTHDC1Q96MU7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
YTHDC1Q96MU7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
YTHDC1Q96MU7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
YTHDC1Q96MU7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
YTHDC1Q96MU7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
YTHDC1Q96MU7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
YTHDC1Q96MU7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
YTHDC1Q96MU7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
YTHDC1Q96MU7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
YTHDC1Q96MU7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
YTHDC1Q96MU7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
YTHDC1Q96MU7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
YTHDC1Q96MU7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
YTHDC1Q96MU7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
YTHDC1Q96MU7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
YTHDC1Q96MU7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
YTHDC1Q96MU7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
YTHDC1Q96MU7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
YTHDC1Q96MU7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
YTHDC1Q96MU7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
YTHDC1Q96MU7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
YTHDC1Q96MU7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms