Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
JSRP1Q96MG2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
JSRP1Q96MG2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
JSRP1Q96MG2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
JSRP1Q96MG2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
JSRP1Q96MG2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
JSRP1Q96MG2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
JSRP1Q96MG2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
JSRP1Q96MG2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
JSRP1Q96MG2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
JSRP1Q96MG2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
JSRP1Q96MG2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
JSRP1Q96MG2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
JSRP1Q96MG2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
JSRP1Q96MG2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
JSRP1Q96MG2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
JSRP1Q96MG2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
JSRP1Q96MG2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
JSRP1Q96MG2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
JSRP1Q96MG2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
JSRP1Q96MG2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
JSRP1Q96MG2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
JSRP1Q96MG2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
JSRP1Q96MG2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
JSRP1Q96MG2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
JSRP1Q96MG2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
JSRP1Q96MG2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
JSRP1Q96MG2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
JSRP1Q96MG2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
JSRP1Q96MG2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
JSRP1Q96MG2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
JSRP1Q96MG2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
JSRP1Q96MG2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
JSRP1Q96MG2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
JSRP1Q96MG2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
JSRP1Q96MG2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
JSRP1Q96MG2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
JSRP1Q96MG2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
JSRP1Q96MG2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
JSRP1Q96MG2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
JSRP1Q96MG2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
JSRP1Q96MG2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
JSRP1Q96MG2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
JSRP1Q96MG2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
JSRP1Q96MG2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
JSRP1Q96MG2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
JSRP1Q96MG2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
JSRP1Q96MG2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
JSRP1Q96MG2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
JSRP1Q96MG2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
JSRP1Q96MG2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
JSRP1Q96MG2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
JSRP1Q96MG2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
JSRP1Q96MG2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
JSRP1Q96MG2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
JSRP1Q96MG2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
JSRP1Q96MG2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
JSRP1Q96MG2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
JSRP1Q96MG2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
JSRP1Q96MG2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
JSRP1Q96MG2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
JSRP1Q96MG2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
JSRP1Q96MG2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
JSRP1Q96MG2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
JSRP1Q96MG2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
JSRP1Q96MG2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
JSRP1Q96MG2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
JSRP1Q96MG2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
JSRP1Q96MG2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
JSRP1Q96MG2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
JSRP1Q96MG2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
JSRP1Q96MG2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
JSRP1Q96MG2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
JSRP1Q96MG2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
JSRP1Q96MG2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
JSRP1Q96MG2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
JSRP1Q96MG2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
JSRP1Q96MG2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
JSRP1Q96MG2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
JSRP1Q96MG2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
JSRP1Q96MG2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
JSRP1Q96MG2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
JSRP1Q96MG2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
JSRP1Q96MG2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
JSRP1Q96MG2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
JSRP1Q96MG2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
JSRP1Q96MG2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
JSRP1Q96MG2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
JSRP1Q96MG2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
JSRP1Q96MG2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
JSRP1Q96MG2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
JSRP1Q96MG2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
JSRP1Q96MG2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
JSRP1Q96MG2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
JSRP1Q96MG2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
JSRP1Q96MG2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
JSRP1Q96MG2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
JSRP1Q96MG2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
JSRP1Q96MG2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
JSRP1Q96MG2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms