Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FGD4Q96M96 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FGD4Q96M96 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FGD4Q96M96 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
FGD4Q96M96 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FGD4Q96M96 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FGD4Q96M96 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FGD4Q96M96 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FGD4Q96M96 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FGD4Q96M96 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FGD4Q96M96 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FGD4Q96M96 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FGD4Q96M96 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FGD4Q96M96 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FGD4Q96M96 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FGD4Q96M96 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FGD4Q96M96 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FGD4Q96M96 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FGD4Q96M96 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
FGD4Q96M96 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FGD4Q96M96 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FGD4Q96M96 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FGD4Q96M96 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FGD4Q96M96 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FGD4Q96M96 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FGD4Q96M96 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FGD4Q96M96 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FGD4Q96M96 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FGD4Q96M96 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FGD4Q96M96 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FGD4Q96M96 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FGD4Q96M96 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FGD4Q96M96 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FGD4Q96M96 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FGD4Q96M96 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FGD4Q96M96 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FGD4Q96M96 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FGD4Q96M96 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FGD4Q96M96 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FGD4Q96M96 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
FGD4Q96M96 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FGD4Q96M96 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGD4Q96M96 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGD4Q96M96 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGD4Q96M96 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGD4Q96M96 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGD4Q96M96 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGD4Q96M96 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGD4Q96M96 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGD4Q96M96 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGD4Q96M96 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGD4Q96M96 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGD4Q96M96 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGD4Q96M96 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGD4Q96M96 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGD4Q96M96 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGD4Q96M96 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGD4Q96M96 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGD4Q96M96 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGD4Q96M96 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGD4Q96M96 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FGD4Q96M96 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FGD4Q96M96 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FGD4Q96M96 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FGD4Q96M96 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
FGD4Q96M96 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FGD4Q96M96 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FGD4Q96M96 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FGD4Q96M96 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FGD4Q96M96 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FGD4Q96M96 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FGD4Q96M96 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FGD4Q96M96 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FGD4Q96M96 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FGD4Q96M96 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
FGD4Q96M96 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FGD4Q96M96 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
FGD4Q96M96 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
FGD4Q96M96 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FGD4Q96M96 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FGD4Q96M96 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGD4Q96M96 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGD4Q96M96 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGD4Q96M96 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGD4Q96M96 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGD4Q96M96 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGD4Q96M96 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGD4Q96M96 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGD4Q96M96 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGD4Q96M96 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGD4Q96M96 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGD4Q96M96 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
FGD4Q96M96 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGD4Q96M96 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGD4Q96M96 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FGD4Q96M96 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FGD4Q96M96 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
FGD4Q96M96 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
FGD4Q96M96 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FGD4Q96M96 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms