Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGCZQ96LD1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGCZQ96LD1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SGCZQ96LD1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGCZQ96LD1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGCZQ96LD1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGCZQ96LD1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGCZQ96LD1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGCZQ96LD1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGCZQ96LD1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGCZQ96LD1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SGCZQ96LD1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SGCZQ96LD1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGCZQ96LD1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGCZQ96LD1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGCZQ96LD1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGCZQ96LD1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGCZQ96LD1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGCZQ96LD1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGCZQ96LD1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGCZQ96LD1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGCZQ96LD1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGCZQ96LD1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGCZQ96LD1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGCZQ96LD1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGCZQ96LD1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SGCZQ96LD1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGCZQ96LD1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGCZQ96LD1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGCZQ96LD1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SGCZQ96LD1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGCZQ96LD1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGCZQ96LD1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGCZQ96LD1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGCZQ96LD1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGCZQ96LD1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGCZQ96LD1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGCZQ96LD1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SGCZQ96LD1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SGCZQ96LD1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SGCZQ96LD1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGCZQ96LD1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGCZQ96LD1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGCZQ96LD1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGCZQ96LD1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGCZQ96LD1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGCZQ96LD1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGCZQ96LD1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGCZQ96LD1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGCZQ96LD1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGCZQ96LD1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGCZQ96LD1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGCZQ96LD1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGCZQ96LD1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGCZQ96LD1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGCZQ96LD1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SGCZQ96LD1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SGCZQ96LD1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGCZQ96LD1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGCZQ96LD1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGCZQ96LD1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGCZQ96LD1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGCZQ96LD1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGCZQ96LD1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGCZQ96LD1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SGCZQ96LD1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGCZQ96LD1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SGCZQ96LD1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SGCZQ96LD1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGCZQ96LD1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGCZQ96LD1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGCZQ96LD1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGCZQ96LD1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGCZQ96LD1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGCZQ96LD1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCZQ96LD1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
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