Protein–RNA interactions for Protein: Q96L42

KCNH8, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH8Q96L42 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
KCNH8Q96L42 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
KCNH8Q96L42 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
KCNH8Q96L42 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
KCNH8Q96L42 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
KCNH8Q96L42 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
KCNH8Q96L42 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
KCNH8Q96L42 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
KCNH8Q96L42 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
KCNH8Q96L42 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
KCNH8Q96L42 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC39.07■■■■□ 3.85
KCNH8Q96L42 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC39.07■■■■□ 3.85
KCNH8Q96L42 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
KCNH8Q96L42 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
KCNH8Q96L42 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
KCNH8Q96L42 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
KCNH8Q96L42 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
KCNH8Q96L42 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
KCNH8Q96L42 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
KCNH8Q96L42 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
KCNH8Q96L42 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
KCNH8Q96L42 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
KCNH8Q96L42 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
KCNH8Q96L42 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
KCNH8Q96L42 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
KCNH8Q96L42 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
KCNH8Q96L42 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
KCNH8Q96L42 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
KCNH8Q96L42 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
KCNH8Q96L42 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
KCNH8Q96L42 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
KCNH8Q96L42 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
KCNH8Q96L42 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC39.02■■■■□ 3.84
KCNH8Q96L42 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
KCNH8Q96L42 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC39.02■■■■□ 3.84
KCNH8Q96L42 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
KCNH8Q96L42 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
KCNH8Q96L42 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
KCNH8Q96L42 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
KCNH8Q96L42 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
KCNH8Q96L42 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
KCNH8Q96L42 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
KCNH8Q96L42 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
KCNH8Q96L42 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
KCNH8Q96L42 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
KCNH8Q96L42 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
KCNH8Q96L42 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
KCNH8Q96L42 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
KCNH8Q96L42 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC38.97■■■■□ 3.83
KCNH8Q96L42 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
KCNH8Q96L42 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
KCNH8Q96L42 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
KCNH8Q96L42 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
KCNH8Q96L42 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
KCNH8Q96L42 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
KCNH8Q96L42 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC38.95■■■■□ 3.83
KCNH8Q96L42 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
KCNH8Q96L42 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
KCNH8Q96L42 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
KCNH8Q96L42 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
KCNH8Q96L42 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
KCNH8Q96L42 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
KCNH8Q96L42 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
KCNH8Q96L42 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
KCNH8Q96L42 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
KCNH8Q96L42 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
KCNH8Q96L42 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
KCNH8Q96L42 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
KCNH8Q96L42 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
KCNH8Q96L42 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
KCNH8Q96L42 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
KCNH8Q96L42 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
KCNH8Q96L42 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
KCNH8Q96L42 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
KCNH8Q96L42 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
KCNH8Q96L42 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
KCNH8Q96L42 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
KCNH8Q96L42 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
KCNH8Q96L42 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
KCNH8Q96L42 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
KCNH8Q96L42 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
KCNH8Q96L42 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
KCNH8Q96L42 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
KCNH8Q96L42 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
KCNH8Q96L42 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC38.85■■■■□ 3.81
KCNH8Q96L42 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC38.85■■■■□ 3.81
KCNH8Q96L42 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
KCNH8Q96L42 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC38.85■■■■□ 3.81
KCNH8Q96L42 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
KCNH8Q96L42 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
KCNH8Q96L42 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
KCNH8Q96L42 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
KCNH8Q96L42 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC38.84■■■■□ 3.81
KCNH8Q96L42 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
KCNH8Q96L42 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
KCNH8Q96L42 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
KCNH8Q96L42 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.81
KCNH8Q96L42 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
KCNH8Q96L42 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
KCNH8Q96L42 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.7 ms