Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK5RAP3Q96JB5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK5RAP3Q96JB5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK5RAP3Q96JB5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK5RAP3Q96JB5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK5RAP3Q96JB5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK5RAP3Q96JB5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK5RAP3Q96JB5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK5RAP3Q96JB5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK5RAP3Q96JB5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK5RAP3Q96JB5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK5RAP3Q96JB5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK5RAP3Q96JB5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK5RAP3Q96JB5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK5RAP3Q96JB5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK5RAP3Q96JB5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CDK5RAP3Q96JB5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK5RAP3Q96JB5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK5RAP3Q96JB5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK5RAP3Q96JB5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK5RAP3Q96JB5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK5RAP3Q96JB5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK5RAP3Q96JB5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK5RAP3Q96JB5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK5RAP3Q96JB5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK5RAP3Q96JB5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK5RAP3Q96JB5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK5RAP3Q96JB5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK5RAP3Q96JB5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK5RAP3Q96JB5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK5RAP3Q96JB5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK5RAP3Q96JB5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK5RAP3Q96JB5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK5RAP3Q96JB5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK5RAP3Q96JB5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK5RAP3Q96JB5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK5RAP3Q96JB5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK5RAP3Q96JB5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK5RAP3Q96JB5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK5RAP3Q96JB5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK5RAP3Q96JB5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK5RAP3Q96JB5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK5RAP3Q96JB5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK5RAP3Q96JB5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK5RAP3Q96JB5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK5RAP3Q96JB5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK5RAP3Q96JB5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK5RAP3Q96JB5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK5RAP3Q96JB5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK5RAP3Q96JB5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK5RAP3Q96JB5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK5RAP3Q96JB5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK5RAP3Q96JB5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK5RAP3Q96JB5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
CDK5RAP3Q96JB5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK5RAP3Q96JB5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK5RAP3Q96JB5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK5RAP3Q96JB5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK5RAP3Q96JB5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK5RAP3Q96JB5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK5RAP3Q96JB5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK5RAP3Q96JB5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK5RAP3Q96JB5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK5RAP3Q96JB5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK5RAP3Q96JB5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK5RAP3Q96JB5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK5RAP3Q96JB5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK5RAP3Q96JB5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK5RAP3Q96JB5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK5RAP3Q96JB5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK5RAP3Q96JB5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK5RAP3Q96JB5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK5RAP3Q96JB5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK5RAP3Q96JB5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK5RAP3Q96JB5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK5RAP3Q96JB5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK5RAP3Q96JB5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDK5RAP3Q96JB5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK5RAP3Q96JB5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK5RAP3Q96JB5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK5RAP3Q96JB5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK5RAP3Q96JB5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK5RAP3Q96JB5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK5RAP3Q96JB5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK5RAP3Q96JB5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK5RAP3Q96JB5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK5RAP3Q96JB5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK5RAP3Q96JB5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK5RAP3Q96JB5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK5RAP3Q96JB5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK5RAP3Q96JB5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK5RAP3Q96JB5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK5RAP3Q96JB5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK5RAP3Q96JB5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK5RAP3Q96JB5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms